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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003071`

染色体: Chr02 坐标: 51561803-51565686 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003071`
名称	SmilChr02G003071
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	51561803 - 51565686 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009696`
GeneID	`131009696`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009696`
原始查询	`SmilChr02G003071`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=29; qcov=0.744; evalue=1.68e-67; confidence=low
Rice	`Os01g0852650` - identity=28.1; qcov=0.634; evalue=5.09e-59; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009696

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793090.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793090.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793090.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793090.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793090.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:51562100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr2:51562115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B31,C23
`Chr2:51562265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B96,C10,D1
`Chr2:51562273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C16
`Chr2:51562325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C87
`Chr2:51562338`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B11
`Chr2:51562338`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B11
`Chr2:51562358`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B22,C17
`Chr2:51562358`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B22,C17
`Chr2:51562410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B105,C17,C21,C73
`Chr2:51562427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B51,B7,C6
`Chr2:51562542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B22,B83,C59,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793090.1

719 aa

360

719

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 253-359 aa PF10551 MULE 278-369 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793090.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	253	359	2.1e-09	38.1	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057793090.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	278	369	1.4e-27	96.6	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937107.1
ATGGAGAACACCGAACCTGATTCTGGCGAAAGAGAGGACGCACGTACAATTCCTCAAGATAAAAGCAATGGTAAAGCAAATTTAATCGAAGCTTTGTTATTTGCTAACAAACCTGATTATGGCGAAGGAGAGGGCGCACGTACAATTCCTCAAGATAAAAGCAAGGGTAAAGCAAAATTAATCGAAGTGCCTGTTAATGATTCCGATGATGATTCGCATGAAGATTTGTTTTTTCCTGAATGCGATGATTCTCTGAAACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009696
ATGGAGAACACCGAACCTGATTCTGGCGAAAGAGAGGACGCACGTACAATTCCTCAAGATAAAAGCAATGGTAAAGCAAATTTAATCGAAGCTTTGTTATTTGCTAACAAACCTGATTATGGCGAAGGAGAGGGCGCACGTACAATTCCTCAAGATAAAAGCAAGGGTAAAGCAAAATTAATCGAAGTGCCTGTTAATGATTCCGATGATGATTCGCATGAAGATTTGTTTTTTCCTGAATGCGATGATTCTCTGAAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793090.1
MENTEPDSGEREDARTIPQDKSNGKANLIEALLFANKPDYGEGEGARTIPQDKSKGKAKLIEVPVNDSDDDSHEDLFFPECDDSLKPRVGLVFPTLEVAEEFYDNYARDCGFETRKGAIRRTKDGTIRKRWMYCNREGGYYKIVTFNEGHTHTMIPEISRQFMMTNRKVGDVQQMIIQSAVKANIGPMKSFRFYKELVGKYDDVGCTSRDFRNYTRDLKGYTKGSDADMLIQEFKKKQQYCDSFKFYYELHEGMNRIRCL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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