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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003076`

染色体: Chr02 坐标: 51683741-51687524 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003076`
名称	SmilChr02G003076
描述	protein WHAT'S THIS FACTOR 9, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	51683741 - 51687524 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010092`
GeneID	`131010092`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010092`
原始查询	`SmilChr02G003076`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein WHAT'S THIS FACTOR 9, mitochondrial
产物	protein WHAT'S THIS FACTOR 9%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G71850` (AT1G71850) Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843515] identity=54.4; qcov=0.634; evalue=1.19e-148; confidence=high
Rice	`Os03g0646200` - identity=39.4; qcov=0.554; evalue=2.98e-84; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF11955 (PORR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010092

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057793466.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057793466.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057793466.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793466.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793466.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:51684147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:51684319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:51684593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr2:51684718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:51684760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C83,D3
`Chr2:51685228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B48,B63,B73,B89
`Chr2:51685392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:51685421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr2:51685620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793466.1

632 aa

316

632

PORR

PF11955 PORR 37-358 aa

XP_057793467.1

632 aa

316

632

PORR

PF11955 PORR 37-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793466.1`	Pfam	`PF11955`	PORR	Family	37	358	3.2e-112	375.4	Plant organelle RNA recognition domain
`XP_057793467.1`	Pfam	`PF11955`	PORR	Family	37	358	3.2e-112	375.4	Plant organelle RNA recognition domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937483.1
AAAATTATCTCGAAAAACAAAAAAAGAGTAGTTTAAACTTTAAACTGACTGAAACATCAAAACAAGCGAAATAGGTAAAACCCTACCAAAACCCCGCCATGAAATTCTTTTCCGCCTGTCACTCCTCCCACCTCCGCCGCTCCCATCGTCACCGCTTCCTCCAGCTCCGCACCCTATACGACGGTGTATCCACCTTGAAATGGCCCCGAGACCGTGGCCTCGACCACGCAGTGGAGCGCGACAAGCTCCTCAAACCCCTC...

XM_057937484.1
AAAATTATCTCGAAAAACAAAAAAAGAGTAGTTTAAACTTTAAACTGACTGAAACATCAAAACAAGCGAAATAGGTAAAACCCTACCAAAACCCCGCCATGAAATTCTTTTCCGCCTGTCACTCCTCCCACCTCCGCCGCTCCCATCGTCACCGCTTCCTCCAGCTCCGCACCCTATACGACGGTGTATCCACCTTGAAATGGCCCCGAGACCGTGGCCTCGACCACGCAGTGGAGCGCGACAAGCTCCTCAAACCCCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010092
ATGAAATTCTTTTCCGCCTGTCACTCCTCCCACCTCCGCCGCTCCCATCGTCACCGCTTCCTCCAGCTCCGCACCCTATACGACGGTGTATCCACCTTGAAATGGCCCCGAGACCGTGGCCTCGACCACGCAGTGGAGCGCGACAAGCTCCTCAAACCCCTCCTCAATCTCAAAAACCTCATAATCTCCGAGCCGTCGAAATCGATCCCGCTTACGCTCATCACCGAATCGAGGGAATCCCTAGGAATCCCATTTCGCCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057793466.1
MKFFSACHSSHLRRSHRHRFLQLRTLYDGVSTLKWPRDRGLDHAVERDKLLKPLLNLKNLIISEPSKSIPLTLITESRESLGIPFRPIEFIRKYPSIFQEFQPGSLNIQPHIKLTPNIISLSSEEDLLYQSVNYKQDIASRLLKLLMVSRINKIPIFVLERLKWELGLPRDYEKALIPEFPDYFRVIGGDDLGENEKVLELVCWGDEFAVSEVEKKGAKSGKIEFSFQFSKEFEMDKKYKKWLDEWQKLPYASPYQNAMH...

XP_057793467.1
MKFFSACHSSHLRRSHRHRFLQLRTLYDGVSTLKWPRDRGLDHAVERDKLLKPLLNLKNLIISEPSKSIPLTLITESRESLGIPFRPIEFIRKYPSIFQEFQPGSLNIQPHIKLTPNIISLSSEEDLLYQSVNYKQDIASRLLKLLMVSRINKIPIFVLERLKWELGLPRDYEKALIPEFPDYFRVIGGDDLGENEKVLELVCWGDEFAVSEVEKKGAKSGKIEFSFQFSKEFEMDKKYKKWLDEWQKLPYASPYQNAMH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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