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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003087`

染色体: Chr02 坐标: 51758673-51759937 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003087`
名称	SmilChr02G003087
描述	putative F-box protein At3g16210
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	51758673 - 51759937 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010100`
GeneID	`131010100`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010100`
原始查询	`SmilChr02G003087`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At3g16210
产物	putative F-box protein At3g16210
Arabidopsis	`AT3G16210` (AT3G16210) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820867] identity=25.5; qcov=0.959; evalue=8.82e-18; confidence=low
Rice	`Os09g0447600` - identity=34; qcov=0.729; evalue=2.25e-18; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010100

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793482.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793482.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057793482.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793482.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793482.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:51759088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:51759115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:51759117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:51759228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr2:51759263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:51759334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B36,B51,C37
`Chr2:51759352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:51759372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B54
`Chr2:51759473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:51759556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:51759595`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A1,B108,B112,B126,B138,B139,B2,B25,B34,B38,B4,B44,B50,B61,B66,B67,B93,B97,C13,C17,C21,C23,C43,C57,C59,C71,C84,D9
`Chr2:51759614`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A1,B108,B112,B126,B138,B139,B2,B25,B34,B38,B4,B44,B50,B61,B66,B67,B93,B97,C13,C17,C21,C23,C43,C57,C59,C71,C84,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793482.1

266 aa

133

266

F-box

F-box-like

FBA_3

FBA_1

PF00646 F-box 7-46 aa PF12937 F-box-like 8-43 aa PF08268 FBA_3 80-255 aa PF07734 FBA_1 102-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793482.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	7	46	7.6e-09	35.8	F-box domain
`XP_057793482.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	8	43	6e-07	29.8	F-box-like
`XP_057793482.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	80	255	5.3e-17	62.5	F-box associated beta propeller domain
`XP_057793482.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	102	260	1.3e-16	61.3	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937499.1
CCAAGAGCACGGCTGAGTCTTGAATTTCTCGATCCATACTTTTGTAATCAATTCTCCAATAAATGGCACAACATTTATTTAACAAACTGGTTACCACAACCTAGAGCTTAGAATCCCACACCAAAATGAAGCAATCAGATTTGTTGACAAACCTACCATCAGACATCATCATCGACATCCTCTCGAGACTCCCCATCCCAACCATCATCCGATGCAAGTCCGTGTGCAAGCCATGGCTCCATCTTCTCCGATCCCACGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010100
ATGAAGCAATCAGATTTGTTGACAAACCTACCATCAGACATCATCATCGACATCCTCTCGAGACTCCCCATCCCAACCATCATCCGATGCAAGTCCGTGTGCAAGCCATGGCTCCATCTTCTCCGATCCCACGAATTCGCCACCCACCATCTCTCGACATCCGCACCAGCCCTCGCCGTCTTCCAGTACAAGATCACCTCAGAGTTGTACGATATCTACGAATTCGAAGATGATGATCAGCACTACAAGCTACTCACGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793482.1
MKQSDLLTNLPSDIIIDILSRLPIPTIIRCKSVCKPWLHLLRSHEFATHHLSTSAPALAVFQYKITSELYDIYEFEDDDQHYKLLTSFMPPCRGMIQGSANGFLVLRDLSLRPHGLSICNPITREYMEIHSPPEFDYTYPQVAAFGFGASRITGQHKVVRVFHGREIPECHVYTLGTGSWRSVASSAPLRYGNGSIGEFLNGNLHWLVFDSNGKPWISCFDLETELFSIISPPLPLRTQRWPVAGVFAFQDKLCVCDNSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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