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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003088`

染色体: Chr02 坐标: 51760407-51761492 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003088`
名称	SmilChr02G003088
描述	F-box protein At3g07870-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	51760407 - 51761492 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009699`
GeneID	`131009699`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009699`
原始查询	`SmilChr02G003088`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At3g07870-like
产物	F-box protein At3g07870-like
Arabidopsis	`AT3G07870` (AT3G07870) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819978] identity=28; qcov=0.87; evalue=1.12e-17; confidence=low
Rice	`Os09g0449600` (OsFbox490) - identity=26.4; qcov=1.01; evalue=4.98e-18; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009699

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793094.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793094.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793094.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793094.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793094.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:51760436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B54
`Chr2:51760437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:51760447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:51760466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A20,B79,C36,C43
`Chr2:51760611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B44,D10
`Chr2:51760622`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B130,B54
`Chr2:51760622`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B130,B54
`Chr2:51760755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:51760771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B59,B6,C63
`Chr2:51760903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr2:51760982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,D8,D9
`Chr2:51761096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793094.1

361 aa

180

361

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 94-332 aa PF07734 FBA_1 100-325 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793094.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	94	332	5.2e-22	79.0	F-box associated beta propeller domain
`XP_057793094.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	100	325	8.3e-20	71.7	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937111.1
ATGAACCAGTATTTCCTCGGAGATCTACCATCAGTAATCAGCTTCGACATTATCTTAAGACTCCCTCCTCGAGCCATTGCAATCAGCAAGTGTGTTTGCAAGCCGTGGCTCCAATTTCTTGAGGCTGATGATTTTGTCAGTTTCCATCTCTCTAAATCCGCCCCTGCCCTAGCTGCGCTGACGATAGAAGATGATTCGAACTGGTGCAAAGTCTTCCAAATAGAAGACGAGCTCGATCACGGCCGCGATCCACTCGCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009699
ATGAACCAGTATTTCCTCGGAGATCTACCATCAGTAATCAGCTTCGACATTATCTTAAGACTCCCTCCTCGAGCCATTGCAATCAGCAAGTGTGTTTGCAAGCCGTGGCTCCAATTTCTTGAGGCTGATGATTTTGTCAGTTTCCATCTCTCTAAATCCGCCCCTGCCCTAGCTGCGCTGACGATAGAAGATGATTCGAACTGGTGCAAAGTCTTCCAAATAGAAGACGAGCTCGATCACGGCCGCGATCCACTCGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793094.1
MNQYFLGDLPSVISFDIILRLPPRAIAISKCVCKPWLQFLEADDFVSFHLSKSAPALAALTIEDDSNWCKVFQIEDELDHGRDPLAKSAIPHGYTIGGSANGLLLLTFYPDYVYVCNPFTRELCDLRSLPKGVAYGFGASRVTGRHKVVSISPNSDCHVYTLGTGSCRRVEAAPFQYSSGSGSFGVLVNGNLHWLVSSGSVDTNLISCFDVETECFSTFPAPPLGSSRKPWRLYNVRDCLCFCEESFHNLNAAEDKINIW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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