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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003130`

染色体: Chr02 坐标: 52333371-52337001 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003130`
名称	SmilChr02G003130
描述	FHA domain-containing protein PS1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	52333371 - 52337001 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010131`
GeneID	`131010131`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010131`
原始查询	`SmilChr02G003130`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FHA domain-containing protein PS1-like
产物	FHA domain-containing protein PS1-like
Arabidopsis	`AT1G34355` (PS1) forkhead-associated (FHA) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840337] identity=40.1; qcov=0.602; evalue=1.67e-77; confidence=medium
Rice	`Os11g0171700` - identity=38.7; qcov=0.494; evalue=4.54e-70; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0031965 (nuclear membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00498 (FHA); PF13638 (PIN_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010131

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793524.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793524.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793524.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793524.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793524.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:52333639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B89
`Chr2:52333645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B45,C26,C9
`Chr2:52333727`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D9
`Chr2:52333727`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D9
`Chr2:52333730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr2:52334444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:52334486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr2:52334801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,D10,D9
`Chr2:52334824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C54,C83
`Chr2:52334949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:52334958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B72,B94,C74
`Chr2:52334997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793524.1

815 aa

408

815

FHA

PIN_4

PF00498 FHA 59-126 aa PF13638 PIN_4 578-743 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793524.1`	Pfam	`PF00498`	FHA	Family	59	126	6.3e-17	62.5	FHA domain
`XP_057793524.1`	Pfam	`PF13638`	PIN_4	Domain	578	743	4.7e-18	66.5	PIN domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937541.1
ATTTTCAAAAAGATTCAATTCAAACTCCCAACTATATTTCTCCTCCCCTTTCCACTCCAATAAACCCCAAAATCAAGGAACCCATTTTCTTCACGATAAGCTTCATCCTCTCACTACAATGGCGGAGAATCAAGAACAAGTGAGGCCAAAGGAGAGAGAAATCCCAGTTTTCACAGTCTTGAAGAATAATTGTATATTGAAGAACATCTTTGTTTTAGACAACCCTCCTCCGATTTCTTCGTCTTCCTCGGCCGAAATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010131
ATGGCGGAGAATCAAGAACAAGTGAGGCCAAAGGAGAGAGAAATCCCAGTTTTCACAGTCTTGAAGAATAATTGTATATTGAAGAACATCTTTGTTTTAGACAACCCTCCTCCGATTTCTTCGTCTTCCTCGGCCGAAATTTCTGGTCAGGAATCGGAAAGGGAAGAGATATTGCTGGTGGGGAGGCACCCCGATTGTAATATAAAGCTGGAGCACCCGAGTATCAGCAGATTTCATCTCCGCATTCACTCTAAGCCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793524.1
MAENQEQVRPKEREIPVFTVLKNNCILKNIFVLDNPPPISSSSSAEISGQESEREEILLVGRHPDCNIKLEHPSISRFHLRIHSKPSSRSLFVTDLSSVHGTCISGKRIEPGVTMELVPGDTLKLGESSRLYRLDWVPISFAYDINDPFVPQPDTLDTVDEETEGADQDENRLSRENEWGWDLSDEIEALGWQETTAEVENTRLPEMLSNENEITGSQLLLLDVSLSADEETEGATEQVKMLSNENEITGSQLLSLDVSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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