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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003142`

染色体: Chr02 坐标: 52437057-52437611 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003142`
名称	SmilChr02G003142
描述	CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 6-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	52437057 - 52437611 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009716`
GeneID	`131009716`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009716`
原始查询	`SmilChr02G003142`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 6-like
产物	CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 6-like
Arabidopsis	`AT4G30960` (SIP3) SOS3-interacting protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829221] identity=47.2; qcov=1.19; evalue=6e-42; confidence=medium
Rice	`Os01g0206700` (OsCIPK05) - identity=37.6; qcov=1.24; evalue=5.45e-37; confidence=medium
GO	GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF03822 (NAF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009716

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057793109.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057793109.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793109.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793109.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793109.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:52437060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D1,D11
`Chr2:52437066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr2:52437093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B71,D5
`Chr2:52437095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,B75,C49,C60
`Chr2:52437101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr2:52437119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B91,C32,C68
`Chr2:52437130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B35,C37
`Chr2:52437131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B98
`Chr2:52437137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr2:52437148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C61,C78
`Chr2:52437158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B73,B99
`Chr2:52437162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B5,B57,C34,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793109.1

153 aa

153

NAF

PF03822 NAF 49-80 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793109.1`	Pfam	`PF03822`	NAF	Domain	49	80	2.6e-06	28.2	NAF domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937126.1
ATGCTGGATCCTAATCCTTCGAGCAGAATAAGCATCGCGAAAATCATAGATTCGTCGTGGTTCAAAAAATCGTCGCTGAAGACGATCAGATCTAAGGAAGAGCAGGAGTTCGCGGCGGAGGATGAGGAGAAGAAGAGGGCGGAGAAGGAGGAGCTGAGGTTCGCGACGACGACGTCGGCGAGCAGCGTGATCTCGAAGCTGGAGGAGGTGGGGAAGACGCGGAACTTCAGAGTGAAGAAGAGCGAGTCGTGCGTGCGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009716
ATGCTGGATCCTAATCCTTCGAGCAGAATAAGCATCGCGAAAATCATAGATTCGTCGTGGTTCAAAAAATCGTCGCTGAAGACGATCAGATCTAAGGAAGAGCAGGAGTTCGCGGCGGAGGATGAGGAGAAGAAGAGGGCGGAGAAGGAGGAGCTGAGGTTCGCGACGACGACGTCGGCGAGCAGCGTGATCTCGAAGCTGGAGGAGGTGGGGAAGACGCGGAACTTCAGAGTGAAGAAGAGCGAGTCGTGCGTGCGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793109.1
MLDPNPSSRISIAKIIDSSWFKKSSLKTIRSKEEQEFAAEDEEKKRAEKEELRFATTTSASSVISKLEEVGKTRNFRVKKSESCVRLQGLESGRKGKLGIAADIFSVTPSFVVVEVKKSSGDTLEYNQFCSKERPALKDIVWTTTAGNFVPTA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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