当前解析结果
SmilChr02G003152| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003152 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003152 |
| 描述 | NAC domain-containing protein 79-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 52553161 - 52553772 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009721 |
|---|---|
| GeneID | 131009721 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009721 |
| 原始查询 | SmilChr02G003152 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | NAC domain-containing protein 79-like |
| 产物 | NAC domain-containing protein 79-like |
| Arabidopsis | AT5G07680 (NAC080)NAC domain containing protein 80 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830661] identity=45.5; qcov=0.678; evalue=1.69e-20; confidence=low |
| Rice | Os09g0497900 (ONAC072)- identity=39; qcov=0.638; evalue=1.44e-11; confidence=low |
| GO | GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009721 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057793113.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793113.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793113.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057793113.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057793113.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:52553435 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:52553452 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:52553677 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr2:52553690 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B108,B50,B95,C23,C57 |
Chr2:52553727 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A9,C75,D1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。