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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003155`

染色体: Chr02 坐标: 52600597-52607693 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003155`
名称	SmilChr02G003155
描述	probable manganese-transporting ATPase PDR2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	52600597 - 52607693 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010150`
GeneID	`131010150`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010150`
原始查询	`SmilChr02G003155`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable manganese-transporting ATPase PDR2
产物	probable manganese-transporting ATPase PDR2
Arabidopsis	`AT5G23630` (PDR2) phosphate deficiency response 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832428] identity=84; qcov=0.884; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0402800` - identity=79.8; qcov=0.884; evalue=6.55e-167; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006874 (intracellular calcium ion homeostasis); GO:0015662 (P-type ion transporter activity); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010150

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057793548.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057793548.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057793548.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793548.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793548.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:52600734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B34,C45,C73
`Chr2:52600771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,D3
`Chr2:52601394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B48,B73
`Chr2:52601418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A15,A8,B102,B135,B74,B86,C10,C19,C28,C35,C58,C75,C86
`Chr2:52605341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B32,C30,C46,C60
`Chr2:52605424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B67,C42
`Chr2:52605429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B57,B99,C46
`Chr2:52605432`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B46
`Chr2:52605432`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B46
`Chr2:52605636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B24
`Chr2:52605693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr2:52605827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937566.1
TAAAAAAATAGCTGGATCCAGAACCGTCGAGAGGTCGCCGAAATGCGCTTATTCACCGGCAAACCGCCTTCAATTTTCATCCTCGCCGTTTTCCTCACCGCCCTTCTCCTCCCCGCCGCCCGATCCGACCCTAATCTGCTGAAGCTGCCGTCTGATCAGCCAGAAAACGACCTCTGCCCGTTGAATTCGGAACCGTATATGTGCCCCGTAAAATGCTTCCGGCCCGACCCGGTTTGCGGGGTGGACGGCGTGACCTATTG...

XM_057937565.1
TAAAAAAATAGCTGGATCCAGAACCGTCGAGAGGTCGCCGAAATGCGCTTATTCACCGGCAAACCGCCTTCAATTTTCATCCTCGCCGTTTTCCTCACCGCCCTTCTCCTCCCCGCCGCCCGATCCGACCCTAATCTGCTGAAGCTGCCGTCTGATCAGCCAGAAAACGACCTCTGCCCGTTGAATTCGGAACCGTATATGTGCCCCGTAAAATGCTTCCGGCCCGACCCGGTTTGCGGGGTGGACGGCGTGACCTATTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010150
ATGCGTACTATATTGTTTTCAACTGAGAGGGTTACTGCAAACAGCTGGGAAAGTGGGCTATTTATTTTGTTCTTGGTAGTATTTTCTCTTATAGCTGCCGGTTATGTCCTTAAAAAGGGTCTTGAGGATCCAACAAGGAGTAAATACAAGCTTCTTCTGAGTTGTTCATTGATTATTACTTCTGTGATTCCCCCCGAACTTCCGATGGAGCTGTCAATAGCTGTTAATACATCACTGATTGCTCTAGCCCGGCGTGGAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057793548.1
MRTILFSTERVTANSWESGLFILFLVVFSLIAAGYVLKKGLEDPTRSKYKLLLSCSLIITSVIPPELPMELSIAVNTSLIALARRGIYCTEPFRIPFAGKVDICCFDKTGTLTSDDMEFSGVGGLTDSEDLETEMSKVPDRTLEILASCHALVFVDNKLVGDPLEKASLKGIDWTYKSDEKAMPKKGGANFVQIVQRHHFASHLKRMAVVVRVQEQFFAFVKGAPETIQERLVDVPGWYVETYKKHTRQGSRVLALAYKS...

XP_057793549.1
MRTILFSTERVTANSWESGLFILFLVVFSLIAAGYVLKKGLEDPTRSKYKLLLSCSLIITSVIPPELPMELSIAVNTSLIALARRGIYCTEPFRIPFAGKVDICCFDKTGTLTSDDMEFSGVGGLTDSEDLETEMSKVPDRTLEILASCHALVFVDNKLVGDPLEKASLKGIDWTYKSDEKAMPKKGGANFVQIVQRHHFASHLKRMAVVVRVQEQFFAFVKGAPETIQERLVDVPGWYVETYKKHTRQGSRVLALAYKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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