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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003184`

染色体: Chr02 坐标: 52986247-52990483 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003184`
名称	SmilChr02G003184
描述	tRNA nucleotidyltransferase cca2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	52986247 - 52990483 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010172`
GeneID	`131010172`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010172`
原始查询	`SmilChr02G003184`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA nucleotidyltransferase cca2
产物	tRNA nucleotidyltransferase cca2
Arabidopsis	`AT1G22660` (AT1G22660) Polynucleotide adenylyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838872] identity=55; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0171200` - identity=57.5; qcov=0.929; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0001680 (tRNA 3'-terminal CCA addition); GO:0003723 (RNA binding); GO:0052929 (ATP:3'-cytidine-cytidine-tRNA adenylyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01743 (PolyA_pol)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010172

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057793576.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057793576.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057793576.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793576.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793576.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:52986451`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B103
`Chr2:52986451`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B103
`Chr2:52986500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B60,B72,B82,C1
`Chr2:52986529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B60,B72,B82,C1
`Chr2:52986580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C74
`Chr2:52987028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:52987029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,B73
`Chr2:52987435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B13,C2
`Chr2:52987513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:52987524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B4,B97,C4
`Chr2:52987794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B35,B69
`Chr2:52987983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B131,B20,C6,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793576.1

588 aa

294

588

PolyA_pol

PF01743 PolyA_pol 106-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793576.1`	Pfam	`PF01743`	PolyA_pol	Domain	106	243	2.2e-31	109.6	Poly A polymerase head domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937593.1
TATTAATGCGATGAAACTGCTAAACACCCGTTTTCTCACTTCCTCTTCCGCAGCCCTTTTTTATCTCTCCTTAAACCCATCCAAATTCCCGCCGCTCTTCGCCCAGCCCCAGCTCCGCAGCTGCAATTTGCAGCTCCGGCCGCTTCGTTTTAGTCAATACTGCTATACCTTTTGCTTCTCGCAAAGCGCTAGCGCGGGAGCGGCAACAATGTGCACATCGCCACCGTCCGTTCACGTGAAGGACCGTATTGATCTGACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010172
ATGAAACTGCTAAACACCCGTTTTCTCACTTCCTCTTCCGCAGCCCTTTTTTATCTCTCCTTAAACCCATCCAAATTCCCGCCGCTCTTCGCCCAGCCCCAGCTCCGCAGCTGCAATTTGCAGCTCCGGCCGCTTCGTTTTAGTCAATACTGCTATACCTTTTGCTTCTCGCAAAGCGCTAGCGCGGGAGCGGCAACAATGTGCACATCGCCACCGTCCGTTCACGTGAAGGACCGTATTGATCTGACGGCCAAGGAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793576.1
MKLLNTRFLTSSSAALFYLSLNPSKFPPLFAQPQLRSCNLQLRPLRFSQYCYTFCFSQSASAGAATMCTSPPSVHVKDRIDLTAKERQIFDRLLQVLRHFNLQTQLRVAGGWVRDKLLGKDCYDIDIALDDMLGREFCEKVNEFLSSAGEETHGIGVIQCNPDQSKHLETARMRLFDVWIDFVNLRAEDYSENSRIPTMRFGTAEEDAYRRDLTINSLFYNINTSSVEDFTGRGIIDLKSGKIVTPLPPKQTFLDDPLRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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