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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003214`

染色体: Chr02 坐标: 53332595-53333152 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003214`
名称	SmilChr02G003214
描述	uncharacterized SmilChr02G003214
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53332595 - 53333152 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009737`
GeneID	`131009737`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009737`
原始查询	`SmilChr02G003214`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0256300` - identity=43.4; qcov=0.344; evalue=8.04e-12; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009737

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057793128.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057793128.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793128.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793128.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793128.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53332632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B20,B58,C86
`Chr2:53332635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,C2,C7,D6
`Chr2:53332644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B96,C16,C38,C55
`Chr2:53332646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr2:53332660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A15,A23,A9,B113,B118,B124,B131,B133,B2,B36,B4,B53,B58,B86,C12,C33,C5,C71,D6,D8
`Chr2:53332670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B59
`Chr2:53332671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A24,B108,C78
`Chr2:53332675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B59,C16,C19
`Chr2:53332695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,C52,D3
`Chr2:53332704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:53332769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B119,B125,C42
`Chr2:53332804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793128.1

154 aa

154

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 29-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793128.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	29	74	2.7e-08	34.5	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937145.1
TGTTATCATCTTTCGAGTGGAGACATGAGTTTCAATTCCGGCTCAGCATCTGGGTCGAGCTCGTGGCGTAGTCGCCGGCAGTTTGAGGGTTCAGACAATCCAAAGTTTTGTACTTGCGAATTTGAAGGTAAAAGGTTGAAGGCTTCGATAATGACCTCATGGACGGAGGAGAATCCGGGTCGGAGATTCTATGGATGTAGGAATTGGAAGTCGAAGAATTGTGGCTATTTTGATTGGATTGACGAACCGATAACTGAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009737
ATGAGTTTCAATTCCGGCTCAGCATCTGGGTCGAGCTCGTGGCGTAGTCGCCGGCAGTTTGAGGGTTCAGACAATCCAAAGTTTTGTACTTGCGAATTTGAAGGTAAAAGGTTGAAGGCTTCGATAATGACCTCATGGACGGAGGAGAATCCGGGTCGGAGATTCTATGGATGTAGGAATTGGAAGTCGAAGAATTGTGGCTATTTTGATTGGATTGACGAACCGATAACTGAAAGAGCTAAGGAGGTTATCAATGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793128.1
MSFNSGSASGSSSWRSRRQFEGSDNPKFCTCEFEGKRLKASIMTSWTEENPGRRFYGCRNWKSKNCGYFDWIDEPITERAKEVINDLKNENVKLMKTKNESSKTATIDMECEIGMLWDVVQEMKEDSNKMMKKIRLVSFLFLASWLVFAYLAIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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