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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003222`

染色体: Chr02 坐标: 53444409-53444987 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003222`
名称	SmilChr02G003222
描述	uncharacterized SmilChr02G003222
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53444409 - 53444987 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009740`
GeneID	`131009740`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009740`
原始查询	`SmilChr02G003222`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=high
产物	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=65.2; qcov=0.807; evalue=2.63e-58; confidence=high
Rice	`Os06g0597250` - identity=53.8; qcov=0.833; evalue=2.71e-57; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009740

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793131.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057793131.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793131.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793131.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793131.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53444413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C41
`Chr2:53444427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,B85
`Chr2:53444436`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B53
`Chr2:53444436`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B53
`Chr2:53444439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B138,B28,C5
`Chr2:53444452`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	30	A3,A9,B101,B109,B115,B121,B124,B140,B17,B26,B33,B41,B5,B53,B59,B66,B70,B71,B80,C45,C48,C75,C80,C81,C86,C87,D1,D11,D2,D4
`Chr2:53444458`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B21,B48
`Chr2:53444458`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B21,B48
`Chr2:53444465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B54,B72,B80,C69
`Chr2:53444467`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B115,B14,B53,B68,C28,C46,C76
`Chr2:53444470`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B32
`Chr2:53444470`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793131.1

192 aa

192

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 30-67 aa PF04827 Plant_tran 136-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793131.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	30	67	2.7e-20	72.6	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057793131.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	136	179	2.9e-17	63.7	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937148.1
ATGGCTGAATATCAAAATGCTACAAAAATTCATGGAGGTTCAGTTCTTGGTCACAAGGTAATCCATCGTGACCGAGAAGCAGCAGCTCATCGTCTCTTCAACGACTATTTTTCTGAAAATCCAACATTCAACGAAGGAATGTTTCGTAGACGCTTTCGAATGTCTCGAAGTCTATTCCTCCGTATTGTTGATGCTGTCAAAAATCATAATGATTTTTTCGAGCAACGCATGGATTGCACAGGAAGATGGGGCTTGTCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009740
ATGGCTGAATATCAAAATGCTACAAAAATTCATGGAGGTTCAGTTCTTGGTCACAAGGTAATCCATCGTGACCGAGAAGCAGCAGCTCATCGTCTCTTCAACGACTATTTTTCTGAAAATCCAACATTCAACGAAGGAATGTTTCGTAGACGCTTTCGAATGTCTCGAAGTCTATTCCTCCGTATTGTTGATGCTGTCAAAAATCATAATGATTTTTTCGAGCAACGCATGGATTGCACAGGAAGATGGGGCTTGTCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793131.1
MAEYQNATKIHGGSVLGHKVIHRDREAAAHRLFNDYFSENPTFNEGMFRRRFRMSRSLFLRIVDAVKNHNDFFEQRMDCTGRWGLSTLQKITVAFRILAYGVPADATDKYINIGESTAIKCVKKFCRAFVKIFSDQYLRSPNANDVARLLYIGKQREFPGMLGSLDCMHWKWKNCSTGRETASRASAGPGEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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