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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003227`

染色体: Chr02 坐标: 53534184-53541115 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003227`
名称	SmilChr02G003227
描述	phosphatidylinositol-3-phosphatase SAC1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53534184 - 53541115 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010211`
GeneID	`131010211`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010211`
原始查询	`SmilChr02G003227`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylinositol-3-phosphatase SAC1
产物	phosphatidylinositol-3-phosphatase SAC1
Arabidopsis	`AT1G22620` (ATSAC1) Phosphoinositide phosphatase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838868] identity=71.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0109100` - identity=66.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle); GO:0043813 (phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate 5-phosphatase activity); GO:0046856 (phosphatidylinositol dephosphorylation)
KEGG	smil00562 (Inositol phosphate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02383 (Syja_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010211

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793611.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057793612.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793612.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793611.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793611.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53536297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B91
`Chr2:53537076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C22,C29,C54,C6
`Chr2:53537303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B82,C1
`Chr2:53537549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B13,B93,B95,C2
`Chr2:53537942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C8,D11
`Chr2:53537964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr2:53537965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,B82,C60,C61
`Chr2:53538231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B107
`Chr2:53538236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr2:53538659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,B82,C60,C61
`Chr2:53538713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr2:53539037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B124,B27,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793611.1

914 aa

457

914

Syja_N

PF02383 Syja_N 117-413 aa

XP_057793612.1

716 aa

358

716

Syja_N

PF02383 Syja_N 2-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793611.1`	Pfam	`PF02383`	Syja_N	Family	117	413	1.4e-82	278.2	SacI homology domain
`XP_057793612.1`	Pfam	`PF02383`	Syja_N	Family	2	215	1.4e-61	209.3	SacI homology domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937628.1
AAATGTTTAAAATGCAAACGCGACTTCGGAATTATGTCATCTTAACCCGATTTCGTTGACAGTTTTGGAGGTTAAGAAAAAGAGCAAAAATGGCTGATACAGCAGAAACTATATAAGCAAAGGGACATTTCACAGTCTAGAAAACATCCAATTATCCAGATAAATTCGATCGAGTATTGCTCGATTCGAGCTCTCAATTCCCGATGTCGAAGCCGGAGAAGCCAAAATCCACTTCAGCGAATCTTCCGCCATCATTCGGG...

XM_057937629.1
ATCGATAGAATGGAGCCTTCTGATTTGAATATCAGTGAAGATCCTGTGGTTTATCCTCCACAAGAAGTCAAGAGCCTGCTCCAACGGATTGGTGAGGGCAATCGTGCCACTGGAGGGTTAACTTTAGTTGCCAAGGTTGCATTAAATTCCTGGAGTCATACTACCTGATACTGGTAACAAAGCGGCGGCAAATTGGATCCATATGTGGTCATGCGATATATAGTATAGATGAGAGTCAAATAATCACTGTTCCACATGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010211
ATGTCGAAGCCGGAGAAGCCAAAATCCACTTCAGCGAATCTTCCGCCATCATTCGGGTCGAATTCTTCCAAAATTCACCCGTCAAACGACCCGGAAGGCCCTCCCGACCCGAATTCATACTCCTTGGAGAAATTCCGCCTCTATGAGACGAGAGCCAGGTTTTATTTGATTGGAAGTGATAGGAATGAGAGGTTTTTTCGGGTATTGAAAATCGATAGAATGGAGCCTTCTGATTTGAATATCAGTGAAGATCCTGTGGT...

LOC131010211
ATGCAAAGTTTACAGAAAAATGTGTTATCAATTGGTGAGGAAGGAATGCCATATGATAACATGTTTGTTTGGAATGCTTTTCTAACTCAAGCAATCCGGTCAAGGTGCAACAACACCATTTGGACAATAGCTCTTGTTCATGGGAATTTTAAACAGGTTAGGCTGTCAATTTTTGGAAGAGACTTCAGTGTTACTCTGGTTTCCAGACGCTCTCGCCATTTTGCTGGGACACGTTATTTAAAACGAGGAGTTAATGATCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057793611.1
MSKPEKPKSTSANLPPSFGSNSSKIHPSNDPEGPPDPNSYSLEKFRLYETRARFYLIGSDRNERFFRVLKIDRMEPSDLNISEDPVVYPPQEVKSLLQRIGEGNRATGGLTLVAKVYGIVGCIKFLESYYLILVTKRRQIGSICGHAIYSIDESQIITVPHVSVQTDVAHSKTELRYKKLLQSVDLTNDFFYSYTYPIMQSLQKNVLSIGEEGMPYDNMFVWNAFLTQAIRSRCNNTIWTIALVHGNFKQVRLSIFGRDF...

XP_057793612.1
MQSLQKNVLSIGEEGMPYDNMFVWNAFLTQAIRSRCNNTIWTIALVHGNFKQVRLSIFGRDFSVTLVSRRSRHFAGTRYLKRGVNDHGRVANDVETEQLVLDEEAGSCKGKMSSVVQMRGSIPLFWSQEASRFSPKPDIILQRYDPTYEATKLHFEDLARRYGNPIIVLNLIKTVEKRPREMMLRREFANAVGYLNQILIEENQLKFIHWDFHKFAKTKSANVLAVLGAVASEALDLTGFYYSGKPLVTKKRTIQLSRTS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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