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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003230`

染色体: Chr02 坐标: 53575562-53577213 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003230`
名称	SmilChr02G003230
描述	uncharacterized SmilChr02G003230
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53575562 - 53577213 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010215`
GeneID	`131010215`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010215`
原始查询	`SmilChr02G003230`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late embryosis abundant domain-containing protein / LEA domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843541]; symbol=AT1G72100; hit=AT1G72100; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	late embryosis abundant domain-containing protein / LEA domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843541]; symbol=AT1G72100; hit=AT1G72100; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G72100` (AT1G72100) late embryosis abundant domain-containing protein / LEA domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843541] identity=37.2; qcov=1.16; evalue=6.78e-82; confidence=medium
Rice	`Os11g0673100` - identity=27.8; qcov=0.412; evalue=6.18e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13664 (DUF4149)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010215

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057793618.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057793618.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057793618.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057793618.1`
5	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057793618.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53575758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:53575777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:53575800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B124,B27,C25,D11
`Chr2:53575887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C58
`Chr2:53575900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:53575963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B55,C47,C8
`Chr2:53576172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr2:53576336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:53576337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B137,B76,C18
`Chr2:53576340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr2:53576363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B130,B136,B139,C61
`Chr2:53576450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C24,C32,C68,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793618.1

427 aa

214

427

DUF4149

PF13664 DUF4149 260-355 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793618.1`	Pfam	`PF13664`	DUF4149	Domain	260	355	1.5e-22	80.4	Domain of unknown function (DUF4149)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937635.1
TAGGTTTCTGCAACAACATGCACCATGCCACGTATCGCAATCTCCAAAACCAACTCCCAAATTTCTTGTAAAATTTATACCAATTCAAACCGATATATATATCCTCTATCATCAGATCCACAAAACTAGCAGAAGCTGAGAATCACAAAAAAATGATGAATTTTGTTGCATTAGGGCTTGTCCTAACGTCTCTGGTGACTGCGGGGTTCTTCGCTCCAACCCCACAAAACCCTAGATCGAGAGGAGAAGACGATGTGATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010215
ATGATGAATTTTGTTGCATTAGGGCTTGTCCTAACGTCTCTGGTGACTGCGGGGTTCTTCGCTCCAACCCCACAAAACCCTAGATCGAGAGGAGAAGACGATGTGATAGTGAAGGAAGGGCACAGAGTTGTAATGGTGGAGTACGAGAAAGACGACGGCAACACCAAGGTTTTGATCTCGCCGCAGGAGAAAGGGTTCGCTGATAAATTGTCTCAGAAAACGGAGAAAGTGAAGGAGGGAGTGAAGGGGGCTTCCTCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793618.1
MMNFVALGLVLTSLVTAGFFAPTPQNPRSRGEDDVIVKEGHRVVMVEYEKDDGNTKVLISPQEKGFADKLSQKTEKVKEGVKGASSSVVDELGNLVGKNEESNENILHKVRPRELVCDAYGKCKHKIASAFEKTKASAAEAASAAEEAAKEAVGRVKDKLEEGKEMVKDSASELSSKAAEGAKEAEAAKEAVSEKAEGAKEAVSEKTRAAKEAARGAGKRGKKELREILRHAGEVAGDAFEYVVPRERVAPVAGVAHLMG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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