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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003231`

染色体: Chr02 坐标: 53579680-53584151 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003231`
名称	SmilChr02G003231
描述	transmembrane 9 superfamily member 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53579680 - 53584151 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010216`
GeneID	`131010216`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010216`
原始查询	`SmilChr02G003231`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane 9 superfamily member 1
产物	transmembrane 9 superfamily member 1
Arabidopsis	`AT1G10950` (TMN1) transmembrane nine 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837638] identity=85.2; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0181100` - identity=83.3; qcov=0.967; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0072657 (protein localization to membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02990 (EMP70)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010216

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057793619.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057793619.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057793619.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057793619.1`
5	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057793619.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53580033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr2:53580141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B1,B95
`Chr2:53580283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr2:53580316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B91
`Chr2:53580788`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B136
`Chr2:53580788`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B136
`Chr2:53580999`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	59	A10,A16,A19,A20,A5,A7,A8,B101,B103,B104,B107,B114,B118,B124,B125,B126,B128,B132,B133,B135,B137,B17,B21,B3,B31,B34,B35,B38,B40,B48,B52,B6,B61,B66,B68,B7,B70,B73,B74,B82,B95,B98,C10,C15,C17,C21,C25,C27,C28,C48,C52,C55,C58,C63,C71,C78,C8,C87,D10
`Chr2:53581003`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	59	A10,A16,A19,A20,A5,A7,A8,B101,B103,B104,B107,B114,B118,B124,B125,B126,B128,B132,B133,B135,B137,B17,B21,B3,B31,B34,B35,B38,B40,B48,B52,B6,B61,B66,B68,B7,B70,B73,B74,B82,B95,B98,C10,C15,C17,C21,C25,C27,C28,C48,C52,C55,C58,C63,C71,C78,C8,C87,D10
`Chr2:53581061`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	54	A10,A16,A19,A20,A5,A7,A8,B101,B103,B104,B107,B114,B118,B124,B125,B126,B132,B133,B135,B137,B17,B3,B31,B34,B35,B40,B48,B52,B6,B61,B66,B68,B7,B74,B82,B95,B98,C10,C15,C17,C21,C25,C27,C28,C48,C52,C55,C58,C63,C71,C78,C8,C87,D10
`Chr2:53581066`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	52	A10,A16,A19,A20,A5,A7,A8,B101,B103,B104,B107,B114,B118,B124,B125,B126,B132,B133,B135,B137,B17,B3,B31,B34,B35,B40,B48,B52,B6,B61,B66,B68,B7,B82,B95,B98,C10,C15,C17,C21,C25,C27,C28,C48,C52,C55,C58,C63,C71,C78,C8,C87
`Chr2:53581232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C2
`Chr2:53582091`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793619.1

583 aa

292

583

EMP70

PF02990 EMP70 48-540 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793619.1`	Pfam	`PF02990`	EMP70	Family	48	540	2.3e-179	598.0	Endomembrane protein 70

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937636.1
GTACCCCACACACAGTCACACAGTCGCACTCGGTGTGGACCATAAACCCAATATTTGCACAATTTTCTTTCTCAATCCCTAAAATTTCTGAAATTACTCCTTAAATTGAAAAGAGTATATGCAGCTGGTAGATTGGATCGAACGGAGACCTCAGTTTTTTGACACAAATCAGAGTGTCTGATAATGTTTTTTTCTTGAGATCTGAAATTCCGGGAAAAAGAATCAAGTGGGATTGAGAAGAATATCTCCATTTCGCTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010216
ATGAGCTCCGCCGTCAAATTTCTCTTCGTCTTCGTATTGTCGTTCGCGTTCTTCGTCGCCTCATCTCTGGGCAAGTATCAGGAGGGTGAAGCTGTCACCTTGTGGGTGAACAAGGTTGGACCTTATAACAATCCTCAAGAAACCTACAACTATTACACCCTTCCCTTTTGTCGCCCAAAGGGCAAGGCAACTCATAAGTGGGGTGGACTCGGTGAGGTCCTCGGAGGAAATGAGCTTATCGACAGCCAAATCGAAATAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793619.1
MSSAVKFLFVFVLSFAFFVASSLGKYQEGEAVTLWVNKVGPYNNPQETYNYYTLPFCRPKGKATHKWGGLGEVLGGNELIDSQIEIKFKRDVEKTPICEIELDATKVKHFKDAIDNSYWFEFFMDDLPLWGFVGEALPDRTHDNRHVLLTHKNLVINYNENQIIHVNLTQENAQPLEEGRVLEMTYSVKWVPTNTSFARRFDVYLDYPFFEHQIHWFSVFNSFMMVIFLTGLVSMILMRTLRNDYAKYAREDDDLETLER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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