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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003234`

染色体: Chr02 坐标: 53601900-53605883 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003234`
名称	SmilChr02G003234
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.10-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53601900 - 53605883 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010218`
GeneID	`131010218`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010218`
原始查询	`SmilChr02G003234`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.10-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.10-like
Arabidopsis	`AT1G22540` (AT1G22540) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838860] identity=65; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0871500` - identity=50.7; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0042937 (tripeptide transmembrane transporter activity); GO:0042938 (dipeptide transport); GO:0055085 (transmembrane transport); GO:0071916 (dipeptide transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2); PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010218

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057793622.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057793622.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057793622.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793622.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793622.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53602188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:53602502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B124,B27,C25
`Chr2:53603480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr2:53603685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:53605472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:53605499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr2:53605517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B95
`Chr2:53605558`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr2:53605558`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr2:53605561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:53605604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793622.1

572 aa

286

572

MFS_1

PTR2

PF07690 MFS_1 53-510 aa PF00854 PTR2 106-529 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793622.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	53	510	3.4e-11	43.4	Major Facilitator Superfamily
`XP_057793622.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	106	529	4.5e-88	296.5	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937639.1
GTTTTCTTTTCACACAATTATGGTACAACAAACTGCACGGGAGAATTTGTGATTTAAATAAAGAAAATGAAGAGAACGACGGATACCAATCACGAGGCGTTTACAATTGTGGTAGACTGGTAGTTGTATAATTTAGCCGCCAAATAATTATCTGCAAAAACAAGCCAACACGAAATACACGAGCTTTATTTTTCTGCTCCGATTACCAGCAGCCGTTGGAATGGCCGCTGCAGCCGCCATTTCCGATGCCGAAGCTCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010218
ATGGCCGCTGCAGCCGCCATTTCCGATGCCGAAGCTCCTCTGCTGGACGACGCCGTCGATGGATCCGTCGACTTCAAAGGCCGCCCCGTTTTCCGATCCAAATCCGGTGGCTGGAGATCCGCTTCCTTCATCATAGGTGTGGAGGTGACAGAGAGGTTTGCTTACTACGGAATTAGCTCCAATTTGATAAGCTACTTGACCGGGCCGCTGGGGCAGTCCACCGCCACGGCGGCGGAGAATGTGAACGCGTGGTCGGGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793622.1
MAAAAAISDAEAPLLDDAVDGSVDFKGRPVFRSKSGGWRSASFIIGVEVTERFAYYGISSNLISYLTGPLGQSTATAAENVNAWSGAASLLPLVGAFLADSFFGRYRMIIAASVLYIVALGSLSLSAVIYSMSSSDCQVAAGMKPCAPSQFQVVLFFFSLYLVAFAQGGHKPCVQAFGADQFDEQDPVESKAKSSFFNWWYFSFCAGVLVSLFILNYIQDNLSWGLGFGIPCIAMCLGLIVFLLGSYTYRFQVQSDERSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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