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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003244`

染色体: Chr02 坐标: 53706086-53708424 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003244`
名称	SmilChr02G003244
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.10-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53706086 - 53708424 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010229`
GeneID	`131010229`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010229`
原始查询	`SmilChr02G003244`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.10-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.10-like
Arabidopsis	`AT1G22540` (AT1G22540) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838860] identity=54.1; qcov=1.16; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0871600` (OsPOT) - identity=48.5; qcov=1.06; evalue=1.43e-177; confidence=high
GO	GO:0006857 (oligopeptide transport); GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2); PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010229

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057793637.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057793637.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057793637.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793637.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793637.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53706606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B50,C23,C57
`Chr2:53706651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B46,B81,B83,C76
`Chr2:53706690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B54,C15,C26
`Chr2:53707387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr2:53707388`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A9,C75,D1
`Chr2:53707388`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A9,C75,D1
`Chr2:53707404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr2:53707528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C74
`Chr2:53707659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B124,B27,C25
`Chr2:53707858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793637.1

518 aa

259

518

MFS_1

PTR2

PF07690 MFS_1 54-460 aa PF00854 PTR2 107-262 aa PF00854 PTR2 274-479 aa

XP_057793638.1

481 aa

240

481

PTR2

PF00854 PTR2 119-225 aa PF00854 PTR2 237-442 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793637.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	54	460	2.2e-14	53.9	Major Facilitator Superfamily
`XP_057793637.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	107	262	2.5e-80	271.0	POT family
`XP_057793637.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	274	479	2.5e-80	271.0	POT family
`XP_057793638.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	119	225	1.1e-69	236.0	POT family
`XP_057793638.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	237	442	1.1e-69	236.0	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937654.1
ATGATGACTACCGAAGCCGCCACTGGAGATGACTCAACGCCGCTGCTGGGTGACGTCGTGACCGGTGCCGTCGCCTTCGATGGAGGCCCCGCTCACCGATCGAAATCCGGCTCTTGGAAATCTGCTTCCTTCATCATTGGTGTCGAAGTAGCAGAGAGATTTGCGTATTATGGAATAAGTTCGAATCTGATCACTTACCTGACGGGCCCGTTGGGAGAATCCACGGCCGCCGCCGCGGCAGCTGTCAACGCCTGGAACGG...

XM_057937655.1
ATGATGACTACCGAAGCCGCCACTGGAGATGACTCAACGCCGCTGCTGGGTGACGTCGTGACCGGTGCCGTCGCCTTCGATGGAGGCCCCGCTCACCGATCGAAATCCGGCTCTTGGAAATCTGCTTCCTTCATCATTGGTGTCGAAGTAGCAGAGAGATTTGCGTATTATGGAATAAGTTCGAATCTGATCACTTACCTGACGGGCCCGTTGGGAGAATCCACGGCCGCCGCCGCGGCAGCTGTCAACGCCTGGAACGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010229
ATGATGACTACCGAAGCCGCCACTGGAGATGACTCAACGCCGCTGCTGGGTGACGTCGTGACCGGTGCCGTCGCCTTCGATGGAGGCCCCGCTCACCGATCGAAATCCGGCTCTTGGAAATCTGCTTCCTTCATCATTGGTGTCGAAGTAGCAGAGAGATTTGCGTATTATGGAATAAGTTCGAATCTGATCACTTACCTGACGGGCCCGTTGGGAGAATCCACGGCCGCCGCCGCGGCAGCTGTCAACGCCTGGAACGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057793637.1
MMTTEAATGDDSTPLLGDVVTGAVAFDGGPAHRSKSGSWKSASFIIGVEVAERFAYYGISSNLITYLTGPLGESTAAAAAAVNAWNGAAMLLPLLGAFVADSFLGRYRTIIIASLLYILGLGLLSLSAALHSSNSSPPLFEVAFFFFSIYLVAFAQGGHKPCVQALGADQFDEEDETELVAKSSFFNWWYFSMNAGICVAQLVLSYIQENLSWELGFGIPCIMMCFALVVYLLGSTTYRFRVRSSQKNPFVRISSALAAA...

XP_057793638.1
MMTTEAATGDDSTPLLGDVVTGAVAFDGGPAHRSKSGSWKSASFIIGVEVAERFAYYGISSNLITYLTGPLGESTAAAAAAVNAWNGAAMLLPLLGAFVADSFLGRYRTIIIASLLYILGGHKPCVQALGADQFDEEDETELVAKSSFFNWWYFSMNAGICVAQLVLSYIQENLSWELGFGIPCIMMCFALVVYLLGSTTYRFRVRSSQKNPFVRISSALAAAAARAEPEDPEQSSGIEEAKELVRIAPIWASCLGYAVM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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