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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003250`

染色体: Chr02 坐标: 53775776-53778754 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003250`
名称	SmilChr02G003250
描述	patellin-3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53775776 - 53778754 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010234`
GeneID	`131010234`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010234`
原始查询	`SmilChr02G003250`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	patellin-3-like
产物	patellin-3-like
Arabidopsis	`AT1G72160` (AT1G72160) Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843547] identity=60.6; qcov=0.608; evalue=1.81e-155; confidence=high
Rice	`Os01g0874700` (P0698A10.10-2) - identity=60.5; qcov=0.606; evalue=5.98e-152; confidence=high
GO	GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF00650 (CRAL_TRIO); PF03765 (CRAL_TRIO_N); PF25099 (GOLD_PATL1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010234

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057793640.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057793640.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793640.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793640.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793640.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53776092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:53776104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B124,B27,C25
`Chr2:53776113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:53776212`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B101,B55,B60,B91,C26,C48
`Chr2:53776218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B93,C13,C39
`Chr2:53776241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B109,B73,C12
`Chr2:53776254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:53776263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C26
`Chr2:53776326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B20,B67,B85,C74
`Chr2:53776329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B108,B126,B96,C26
`Chr2:53776404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C82
`Chr2:53776427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C83,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793640.1

576 aa

288

576

CRAL_TRIO_N

CRAL_TRIO

GOLD_PATL1_C

PF03765 CRAL_TRIO_N 230-270 aa PF00650 CRAL_TRIO 297-459 aa PF25099 GOLD_PATL1_C 480-564 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793640.1`	Pfam	`PF03765`	CRAL_TRIO_N	Domain	230	270	2.5e-10	41.1	CRAL/TRIO, N-terminal domain
`XP_057793640.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	297	459	1.6e-31	109.9	CRAL/TRIO domain
`XP_057793640.1`	Pfam	`PF25099`	GOLD_PATL1_C	Domain	480	564	7.5e-35	119.3	Patellin-1-like, C-terminal GOLD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937657.1
TGGAGAAGAAAAAGAAGAGGGGTGTGTGGTGGAGGTGGGTCCCCTTTCGAGAGTGGTAACGAGCTGGCAAATTCCCAAAACTTGACAGACTGTTCCGCTTCACACACACTACACACACTCAGCCTCCTTCCTCTTCAAATTCCACCTAAAAAATCTCATTTCAATCCATTCGTCTCCCTCAATCACCCTCTCTCTCTCAAAAAGATTCAATCTTTCCACCTTTTTCTTATCAAAATCTCCAAAATTTTCCAGTTTCCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010234
ATGGCCGAGGAAACCAAGAAGACGGCGGCTCCCGAGGCGGCAGCATGCGCGGCTGAGGAGGTGCCGGTGACCGACGTGCCGGTGGCGGAGAAGCCCACTGCCCCGGAGAAGGACGTACCCCCGCAGCCGGAGCCCGAGCCCGAGCCGGAAAAGGTGGCGGCGCCTGCTGAGGAGAAGGAGAAAGATGAAGCGGCGACGGCGGATGAGAAGATTGCTGAATCCGCTTCCTTTAAAGAGGAGAGCAACAAAGTCGATGACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793640.1
MAEETKKTAAPEAAACAAEEVPVTDVPVAEKPTAPEKDVPPQPEPEPEPEKVAAPAEEKEKDEAATADEKIAESASFKEESNKVDDLVDPEKKALDEFKLLIQEALNKHEFTAPPPPPPAKEEEKKEEAEAKPEEKKEAEKEETKTEEEPKIESCEAPPAEIPPPKPATEEPAVEKKVEEATPPPCEEKSEAAEEIKETIVHEVTAPTPPPCEEPATAPAAEEPAPPQAPEEVSIWGVPLLADERSDLILLKFLRARDFK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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