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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003251`

染色体: Chr02 坐标: 53804462-53809122 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003251`
名称	SmilChr02G003251
描述	uncharacterized SmilChr02G003251
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53804462 - 53809122 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010235`
GeneID	`131010235`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010235`
原始查询	`SmilChr02G003251`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin interaction motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840956]; symbol=AT1G43690; hit=AT1G43690; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ubiquitin interaction motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840956]; symbol=AT1G43690; hit=AT1G43690; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G43690` (AT1G43690) ubiquitin interaction motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840956] identity=59.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0421800` - identity=66.8; qcov=0.482; evalue=8.63e-137; confidence=medium
GO	GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0071108 (protein K48-linked deubiquitination); GO:1990380 (K48-linked deubiquitinase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13898 (MINDY-3_4_CD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010235

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793641.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057793641.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057793641.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057793641.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057793641.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53804861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B51,C85,D10
`Chr2:53804977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr2:53805000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:53805020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B42,B43
`Chr2:53805238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C55,C85
`Chr2:53805333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B15,B73
`Chr2:53805370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:53806604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr2:53806807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C65
`Chr2:53806879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:53807150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,D10
`Chr2:53808399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793641.1

612 aa

306

612

MINDY-3_4_CD

PF13898 MINDY-3_4_CD 119-432 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793641.1`	Pfam	`PF13898`	MINDY-3_4_CD	Domain	119	432	2.5e-63	214.9	Deubiquitinating enzyme MINDY-3/4, conserved domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937658.1
AATTTTGCCTTTGAAGGATACAGCTGTAATTTCCGAAAAAGCGCACACACAGCCGCGTCGACACTCGCTCGAAACGTCACCGTATTCCCCTCCCTCGCCCAACCGGAAAATTTTCCGTTAAAATATTTTAGATTTAAAAACCCCACTCACTGTTTTCTCGAATTCCTGATGTTGCAAATCTGATATTTACGCCAAACTGCTATTCTGCTTCTCCATGCTTATGATTGTTCCTGCAAATTCCATTATTAAGTTTGAATTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010235
ATGTCGATTGCGGATCAAGAAGATGAGGATTTGAAGATGGCGCTGCGACTGAGCATGCAGCAACACGAGTCGCCTGAGCCGAAGCGGAGCAAGTCCAAGGAGGACTCCGGCGCAGAAGGGTCGCCGGAGGAGTCTCCGGAGGCGAAGAACAGGCAGGTGCAACGGGAAATAATGGCTGCTGCTGCTGAGAAGCGGATGGCTGCCGCCTCGAGCGTGGAAGTTGTGGAGGATGTGTATATGGTGGGTCCAGATGATGAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793641.1
MSIADQEDEDLKMALRLSMQQHESPEPKRSKSKEDSGAEGSPEESPEAKNRQVQREIMAAAAEKRMAAASSVEVVEDVYMVGPDDEAKGKGLSLDEGEAKNRDSGMELPVAEANQLFSMIFGEGVSKEVLAQWCNQGIRFSLDPETSMGLVQQEGGPCGVLAAIQGFVLKYLLFSPEETGNVVPNNFSNLAIRRESNYVPVAADMFSSLSEGKKSRALVRSMSEILFLCGGNKEAVIASLNILGDETARAAQGSEDEVIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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