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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003256`

染色体: Chr02 坐标: 53862311-53871360 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003256`
名称	SmilChr02G003256
描述	uncharacterized SmilChr02G003256
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53862311 - 53871360 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010243`
GeneID	`131010243`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010243`
原始查询	`SmilChr02G003256`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP-dependent protease La (LON) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840423]; symbol=AT1G35340; hit=AT1G35340; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ATP-dependent protease La (LON) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840423]; symbol=AT1G35340; hit=AT1G35340; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G35340` (AT1G35340) ATP-dependent protease La (LON) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840423] identity=56.6; qcov=0.878; evalue=4.83e-100; confidence=high
Rice	`Os11g0219000` (OsClp12) - identity=60.2; qcov=0.316; evalue=2.39e-27; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02190 (LON_substr_bdg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010243

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057793663.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057793663.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793663.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793663.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793663.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53862606`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B59,B60,B64,B79
`Chr2:53862606`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B59,B60,B64,B79
`Chr2:53863346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C74
`Chr2:53863379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B68
`Chr2:53863397`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	56	A10,A19,A23,B113,B119,B12,B123,B127,B132,B134,B135,B20,B24,B25,B26,B28,B40,B44,B45,B49,B51,B56,B59,B65,B68,B69,B71,B73,B74,B75,B77,B79,B87,B93,B96,C14,C32,C34,C37,C4,C44,C57,C60,C61,C62,C67,C69,C74,C76,C79,C81,C84,C85,C86,C87,D6
`Chr2:53863454`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	47	A19,A23,A24,B101,B108,B119,B12,B123,B127,B131,B134,B14,B28,B33,B44,B45,B49,B51,B56,B69,B71,B74,B85,B96,C10,C11,C14,C32,C34,C4,C44,C46,C49,C53,C60,C62,C67,C68,C7,C79,C81,C82,C83,C84,C85,D11,D6
`Chr2:53863484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B109,B70,C48
`Chr2:53864097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B63,B89
`Chr2:53864152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:53868289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr2:53868420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:53869142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793663.1

294 aa

147

294

LON_substr_bdg

PF02190 LON_substr_bdg 52-189 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793663.1`	Pfam	`PF02190`	LON_substr_bdg	Family	52	189	5.3e-15	56.6	ATP-dependent protease La (LON) substrate-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937680.1
CCCTTTCCAAGGCCCCCCCAACCCCCACAAAATCCCTTCGTCTACCTTCACATCCCCTTCCCCAATTTCCCATCAAAACTGCTGTTTTGCTTCTTCTTTGCAAGTGAAGGAAAGTTACTCCTATTCTATTCCTTCCTTTTATTCGCCTTAACTATTGCTGTGAAAATTATTAGATGCATACAATTAGTTTTGATGGCGACGGCGATGGAGAAGTTGGTAGTGCAAGGTCTAGGCCGCAGAGATACGCCGGGGAAAGCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010243
ATGGCGACGGCGATGGAGAAGTTGGTAGTGCAAGGTCTAGGCCGCAGAGATACGCCGGGGAAAGCTAATCCCCATTCCTCATTTGCTTCGCCTCTCACTTCCCCATTTCGACGCCGCCGCCGCCGTTTCCAGCTCCGGGCTTCGTCTCTGGTGCTCCCGCTTCTGCCTTTCCCCATCGACCAGGTCCTGATTCCATCTGAGGTTAAAAGCCTTCATCTATATGAAGCAAGGTATATAGCGCTGCTGGAAGAGTCTTTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793663.1
MATAMEKLVVQGLGRRDTPGKANPHSSFASPLTSPFRRRRRRFQLRASSLVLPLLPFPIDQVLIPSEVKSLHLYEARYIALLEESLFKKNKLFVHFVLDPIGLGGTSIEASFAARYGCLVTIEKVEKLEIGALVLIRGVGRVKLLEFKKAQPYLTGEVTPMQDNVPLNMIEINSEVLKLKEVLHNLKRLEIKLKTPGETLLQTQITNSLVWTEKQITLDCIKDFVPSVAERVSFAALQPVSGSTQSELAKLQKEKLAAME...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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