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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003258`

染色体: Chr02 坐标: 53884128-53887403 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003258`
名称	SmilChr02G003258
描述	uncharacterized SmilChr02G003258
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53884128 - 53887403 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010246`
GeneID	`131010246`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010246`
原始查询	`SmilChr02G003258`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase RNF170-like protein (DUF 1232) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843549]; symbol=AT1G72175; hit=AT1G72175; species=arabidopsis; confidence=high
产物	E3 ubiquitin-protein ligase RNF170-like protein (DUF 1232) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843549]; symbol=AT1G72175; hit=AT1G72175; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G72175` (AT1G72175) E3 ubiquitin-protein ligase RNF170-like protein (DUF 1232) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843549] identity=56; qcov=0.962; evalue=7.17e-57; confidence=high
Rice	`Os03g0839000` (OSJNBa0042I09.10) - identity=47.9; qcov=0.929; evalue=7.25e-57; confidence=high
GO	GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF06803 (DUF1232)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010246

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057793667.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057793667.1`
3	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057793666.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057793666.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057793666.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53885527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B137,B76,C18
`Chr2:53885961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C65
`Chr2:53887086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B124,B27,C25,C34
`Chr2:53887157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793666.1

181 aa

181

DUF1232

PF06803 DUF1232 125-160 aa

XP_057793667.1

182 aa

182

DUF1232

PF06803 DUF1232 126-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793666.1`	Pfam	`PF06803`	DUF1232	Family	125	160	2.3e-10	40.8	Protein of unknown function (DUF1232)
`XP_057793667.1`	Pfam	`PF06803`	DUF1232	Family	126	161	2.1e-10	40.9	Protein of unknown function (DUF1232)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937683.1
ATTCGAGCTTGAACATCATATATACGAACATCTAACGAGCCGAGCTCGAGCTCGATTTCGAATTCGACATTATCGAGCATCACCCGAGCCGAACTCGAACCGAGCTCGAGCTTAGTAAGTGGGTGACGAGCCGAGCTCGATCATCAAGATAAAAGCTCGAATCGAGCTCGAGCCGAGCTCGAACACCCGAATATTTAAACGAGCCGAGCTCGAGCCTGCTAGTATTCGGCTCGGCTCGGCTCGTTTACAGCCCTAGAAAT...

XM_057937684.1
CAACAATGTCCAAACCCCTATATAGATTCATAAAATACCAAATCCCAACTCTCACAGCGTAAGATTGCTAGAGCGTGGGAGATGATACACAGAGGAGAGAAATCTGCGATTTGAAGAGAGAAAAGAGCTACAATCTGCGATTTGAAGAGAGAGAAAATGGACGGGCCTCCGGTTAATGATGTATGCTCGATATGCCATCAGAACTTTCACATTCCTTGTCAAGCCAATTGCAGCCATTGGTTCTGTGTGGGTTCGCCCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010246
ATGGACGGGCCTCCGGTTAATGATGTATGCTCGATATGCCATCAGAACTTTCACATTCCTTGTCAAGCCAATTGCAGCCATTGGTTCTGTGGTAGTTGTATCTTACAAGTTTGGGATCACACTTCTGCTCTTCGCCCATGTAAATGTCCAATGTGCAGACGTGAGATTACATTGTTGGTTCCTAGTGTGGCACACCATGCGGCTGATGTAGCTGAGATTTTGCAGAGGATCGAACATTACAACCGTCAATTTGGTGGAAG...

LOC131010246
ATGATGTATGCTCGATATGCCATCAGAACTTTCACATTCCTTGTCAAGCCAATTGCAGCCATTGGTTCTGTGTGGGTTCGCCCCTCCTTTTCAGGTAGTTGTATCTTACAAGTTTGGGATCACACTTCTGCTCTTCGCCCATGTAAATGTCCAATGTGCAGACGTGAGATTACATTGTTGGTTCCTAGTGTGGCACACCATGCGGCTGATGTAGCTGAGATTTTGCAGAGGATCGAACATTACAACCGTCAATTTGGTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057793666.1
MDGPPVNDVCSICHQNFHIPCQANCSHWFCGSCILQVWDHTSALRPCKCPMCRREITLLVPSVAHHAADVAEILQRIEHYNRQFGGSPNGLMQRMQDLPFLLKRLLRDIMNPQNALPVVMRARVYLAMVLSAMYVLSPVDIIPEALLGIIGLLDDLIVVFTCFMYVAALYRTVLVNRHGGA

XP_057793667.1
MMYARYAIRTFTFLVKPIAAIGSVWVRPSFSGSCILQVWDHTSALRPCKCPMCRREITLLVPSVAHHAADVAEILQRIEHYNRQFGGSPNGLMQRMQDLPFLLKRLLRDIMNPQNALPVVMRARVYLAMVLSAMYVLSPVDIIPEALLGIIGLLDDLIVVFTCFMYVAALYRTVLVNRHGGA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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