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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003259`

染色体: Chr02 坐标: 53887621-53891197 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003259`
名称	SmilChr02G003259
描述	probable polygalacturonase At1g80170
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53887621 - 53891197 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010241`
GeneID	`131010241`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010241`
原始查询	`SmilChr02G003259`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable polygalacturonase At1g80170
产物	probable polygalacturonase At1g80170
Arabidopsis	`AT1G23460` (AT1G23460) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838954] identity=67.3; qcov=0.82; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0130200` (OsPGL15) - identity=54; qcov=0.822; evalue=1.23e-148; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010241

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057793660.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057793660.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793660.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793660.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793660.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53887969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,B60,B64,B79
`Chr2:53888524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:53889559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr2:53889597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A22,B127,B23
`Chr2:53889597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B127,B23
`Chr2:53889637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:53889660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B50,C23,C57
`Chr2:53889764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C2
`Chr2:53889772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B50,C23,C57
`Chr2:53889911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C1
`Chr2:53890903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:53890910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793660.1

455 aa

228

455

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 98-421 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793660.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	98	421	2.7e-94	316.6	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937677.1
AAATTAATATTTACATTTTCTTCATGCCATTTTGAAGTCAAGCCAAAAAACCCCACAAAAAAATGAAAACATCCACTCCATTTGAAATAAATACTAATACTAATTTAAACCCTATATATTAATACCAAAACATGTATATCCATGCACATAAACTAATCCATAGATGATCACTACAAGAAAACATCCTTAAAATCATGAACACACTAAACTTGCTTTGCTTTCTCCTCTTGCTAGCTCTGCCCCTTACACTTGCAAGTATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010241
ATGAACACACTAAACTTGCTTTGCTTTCTCCTCTTGCTAGCTCTGCCCCTTACACTTGCAAGTATACAAAATTCCGACAGCTTCAACGACGACGACGACCCTTTTGAGTTGCAAGAAACAGACGAAGAAGATGGGTTTGATGAGTTCATAAACTTGCCAGATTGGGAAACTGACGGTTGGAAAAAGGCTCCTGTCTCAAACGTGGATTCATTTGGTGCAGTTGGAGATGGAGTTTCTGATGATACTAAGGCATTTGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793660.1
MNTLNLLCFLLLLALPLTLASIQNSDSFNDDDDPFELQETDEEDGFDEFINLPDWETDGWKKAPVSNVDSFGAVGDGVSDDTKAFVDAWKKACSTRGSIFLVPKGQRYLVNATKFKGPCAGKLTIQIEGSMIAPDDPETWDPDYPRMWLGFYNLSNVSFQGKGVIDGSGSKWWAASCKRNKSNPCRGAPTALTIDSSSSVRVKDLTVRNGQQMNFVIGRSESVRVSGVTVWAPGDSPNTDGIHITASTDVVLHNCIIGTG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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