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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003260`

染色体: Chr02 坐标: 53895691-53899274 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003260`
名称	SmilChr02G003260
描述	nuclear cap-binding protein subunit 2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53895691 - 53899274 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010244`
GeneID	`131010244`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010244`
原始查询	`SmilChr02G003260`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear cap-binding protein subunit 2
产物	nuclear cap-binding protein subunit 2
Arabidopsis	`AT5G44200` (CBP20) CAP-binding protein 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834443] identity=77.8; qcov=1.02; evalue=2.95e-125; confidence=high
Rice	`Os02g0612300` (du3) - identity=74.1; qcov=0.945; evalue=1.62e-121; confidence=high
GO	GO:0000339 (RNA cap binding); GO:0005846 (nuclear cap binding complex); GO:0045292 (mRNA cis splicing, via spliceosome)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010244

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793664.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057793664.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793664.1`
4	Chromatin	染色质	0.20000	`XP_057793664.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057793664.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53896343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C77
`Chr2:53897649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr2:53898081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B68
`Chr2:53898212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr2:53899015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B139,B97,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793664.1

253 aa

126

253

RRM_1

PF00076 RRM_1 36-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793664.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	36	106	3.6e-13	49.9	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937681.1
GGGGGTATATTTAAAATTATCTTTATAAAATTTCACAAGAAGTTGATGGCCCAATGTTGGCTTAATCTAGCCCAAAACATTAGTTTTCTTCGACTCGAATAACAAAAGCCTGACCCATTTAATTTATTTCAACTTACAATTTGTAATTTATTTTGGAAAATTTCCCAGTCACGCATTAGGGCTTCGTTTTCTCCCATTTTTCTCACTGAAAATCAAAATTTGCTGGTGGGAATCTCCGATGGCCTCACTCTTTAAGGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010244
ATGGCCTCACTCTTTAAGGATCCGACAAAATTGTCGGCCTATAGGGACAGAAGGTTTTCCGGGACGCAGGAAGAGTACGAGGAGGCGCTGCTGACATCGACCACCGTCTACGTGGGCAACATGTCGTTTTACACGACGGAGGAGCAGGTGTACGAGCTGTTCTCTCGGGCGGGGGAGATAAAGAAGATGGTTATGGGTTTGGATAAGAACAGCAAGACCCCTTGCGGGTTCTGCTTCGTAATGTACTACTCCAGAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793664.1
MASLFKDPTKLSAYRDRRFSGTQEEYEEALLTSTTVYVGNMSFYTTEEQVYELFSRAGEIKKMVMGLDKNSKTPCGFCFVMYYSREDAEDTVKYISGTILDDRPIRVDFDWGFQEGRQWGRGRSGGQVRDEYRTDYDPGRGGYGKIVQKELEAQRQLVDYGAGSLGSFAPVMQPNYGRQGGNYGQGGSYRHGRDYPRKRHREDDRRGPDFQRRKSDFVYRRNPDNEPRPEKNPRFRESGDSDEEEDDDRKRPS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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