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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003263`

染色体: Chr02 坐标: 53917226-53920092 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003263`
名称	SmilChr02G003263
描述	uncharacterized SmilChr02G003263
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53917226 - 53920092 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010245`
GeneID	`131010245`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010245`
原始查询	`SmilChr02G003263`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0450100; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os04g0450100; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G24380` (AT4G24380) dihydrofolate reductase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828540] identity=62.5; qcov=0.799; evalue=1.21e-107; confidence=high
Rice	`Os04g0450100` - identity=67.9; qcov=0.757; evalue=1.62e-113; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03959 (FSH1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010245

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057793665.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057793665.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057793665.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793665.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793665.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53917516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr2:53917625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:53917626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B35
`Chr2:53918434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B127,B23
`Chr2:53918458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr2:53918533`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C19
`Chr2:53918533`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C19
`Chr2:53918878`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C54
`Chr2:53918878`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C54
`Chr2:53919503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C74
`Chr2:53919506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,B8
`Chr2:53919581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B11,C55,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793665.1

284 aa

142

284

FSH1

PF03959 FSH1 56-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793665.1`	Pfam	`PF03959`	FSH1	Domain	56	247	4.8e-49	167.6	Serine hydrolase (FSH1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937682.1
ATATATTATATATTTTTTTTAAACCCACTATGTGTTGTGTTTATCACGTGTAAGATAATAGCCCCCCTCTAACTCTCTAAGAACCTTCGCCGGCTACGCCATGAGTGGCGTTTGCAGCCACTCATCCCCAATTTTCATTTATTCCTCATTTAAATTTATAGTCCACGCGCACAGATTCAATAGCTTTCACACTCAACGATTCCACACGTTATATATACGACAGCAATCACATGTTTTTGAGCACGACGAATCACTCCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010245
ATGTTTTTGAGCACGACGAATCACTCCATTCTGTCCCCCGCTGCGGAACTCACAACAATTTTCAGGCGAGACGAGAGAGAAAGCATAAATTTATTTAGAGAGAGAGGCATCGGTTTATTTTGTCCGAAGAAGATGGGGAGTGAAGGAGCAGAGATGAAGGGTTCGAGGAAATTGAGGTTGCTGTGTCTCCACGGATTCCGCACCAGCGGCGAAATCATCAAGAAACAAGTCACCGGGAAATGGCCGGAATCTGTGCTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793665.1
MFLSTTNHSILSPAAELTTIFRRDERESINLFRERGIGLFCPKKMGSEGAEMKGSRKLRLLCLHGFRTSGEIIKKQVTGKWPESVLEKLDLVFADAPFPCQGKSDVEGIFDPPYYEWFQFNKEFSTYENFDECLAYIEDLMLKHGPFDGLLGFSQGAILSAGLAGMQANGVALTRVPKIKLVVIIGGAKFRNPSVVEQAYSAPIRCRSVHFLGDQDFLKEYGTELLDSFVDPLVIRHPKGHTIPRFDEKGLESMLSFLEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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