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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003267`

染色体: Chr02 坐标: 53936879-53938637 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003267`
名称	SmilChr02G003267
描述	immune-associated nucleotide-binding protein 9-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	53936879 - 53938637 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010252`
GeneID	`131010252`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010252`
原始查询	`SmilChr02G003267`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	immune-associated nucleotide-binding protein 9-like
产物	immune-associated nucleotide-binding protein 9-like
Arabidopsis	`AT1G33970` (AT1G33970) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840294] identity=49.8; qcov=0.9; evalue=2.43e-69; confidence=high
Rice	`Os02g0557100` - identity=48; qcov=0.877; evalue=1.94e-68; confidence=high
GO	GO:0005525 (GTP binding)
KEGG	-
Pfam	PF01926 (MMR_HSR1); PF04548 (AIG1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010252

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endosome	内体	0.80000	`XP_057793671.1`
2	Endosome membrane	内体膜	0.80000	`XP_057793671.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057793671.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057793671.1`
5	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057793671.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:53937286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B46,B50,B8,C5,C86
`Chr2:53937331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B59,C28,D3,D8
`Chr2:53937333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:53937340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B122
`Chr2:53937340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr2:53937367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B68
`Chr2:53937515`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D3
`Chr2:53937515`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D3
`Chr2:53937575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B73
`Chr2:53937619`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B94
`Chr2:53937619`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B94
`Chr2:53937944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C55,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793671.1

261 aa

130

261

AIG1

MMR_HSR1

PF04548 AIG1 21-232 aa PF01926 MMR_HSR1 22-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793671.1`	Pfam	`PF04548`	AIG1	Domain	21	232	9.6e-73	244.7	AIG1 family
`XP_057793671.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	22	113	2.5e-06	28.3	50S ribosome-binding GTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937688.1
TAGATATAGAAGAGTGAATCTTCGTCTCTTCGTATCTCCATCATCTGAAATCGAACATAGATAGAGAAGCTCACTCGTATCAAAAGTTGGAAAACTGTTCCAATTCGTCTCGGAATGTGGAAAGCCACTCGTGTAGCAGCAATAAAATCCATATCCCCACAAATGCTTGAAACCAAAGCGTCTCTGCAGTTCATCCCTTCACGGAGAAGATCAATTTTTCCTCTGTTTCCTAATTCCTTGACCCGATTGTCGCAATGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010252
ATGGCTGGTGGTTCATCGTATAGCGACTACGAGGAGGTTCGCGGCGGCGCCGCCGACGCTAGAACCATCGTTTTAGTAGGTAAGATGGGTAACGGCAAAAGCGCCACCGGGAACAGCCTCATTGGCCGCGAGGTGTTCGATTCTATGCTTAGCCTAGGCGGCGTAACCGCCACTTGCAAACTCGAGACCACTGTCTTAGACGATGGCCGAATTCTCAACGTCGTAGACACTCCCGGTTTATTTGATCCTTCTGTGGAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793671.1
MAGGSSYSDYEEVRGGAADARTIVLVGKMGNGKSATGNSLIGREVFDSMLSLGGVTATCKLETTVLDDGRILNVVDTPGLFDPSVEPNVMAKEIANCINLAKDGIHAVLLVLTLGSRFTEEEGSTFESLCEIFGGKIADYMIVVFAHGDLLRNNLTLDRYLGSNCPEQLTKTLAMCGNRTAVFNNMTEDKVKIRKQREELLSLVESVVSHNAAKPYTNDLFQQLKKHQINESRQKKCSEKKVGGEQFERLIEKVMLEFHQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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