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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003280`

染色体: Chr02 坐标: 54109989-54111942 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003280`
名称	SmilChr02G003280
描述	uncharacterized SmilChr02G003280
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54109989 - 54111942 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009745`
GeneID	`131009745`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009745`
原始查询	`SmilChr02G003280`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009745

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057793137.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793137.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057793137.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793137.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793137.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54110061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B103,B21
`Chr2:54110061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B21
`Chr2:54110087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B58
`Chr2:54110131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C13
`Chr2:54110132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:54110206`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B13,B131,B75,C13,C29,C35,C64
`Chr2:54110214`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B13,B131,B75,C13,C29,C35
`Chr2:54110228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C29
`Chr2:54110264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B25,C14,C32,C45,C68
`Chr2:54110269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr2:54110338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C71,D10
`Chr2:54110338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793137.1

595 aa

298

595

RRM_1

PF00076 RRM_1 55-124 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793137.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	55	124	5.6e-10	39.7	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937154.1
ATGTCTGGAGAGTGGAGAGAGGTGAGGAGGAGAGGGGTAGGTCCTTCCCATCCCGAGCGTTATCCGGTGAGGCAGAAATATTACCCTAACCATAGGTACACCCCCAAAACCCAGTCAGTTGGTTGTCGGAGTTCGCTGGGTTCGGTCGGTGAAGGTTTCACCGTCTTTTTCAATAACTTTCCGGAGGGGACTTGGCTGGAAACCCTGGAAAGAAGATTCAGAAATCTTGGGAAGGTAATCGACATTTTTCGTCCAAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009745
ATGTCTGGAGAGTGGAGAGAGGTGAGGAGGAGAGGGGTAGGTCCTTCCCATCCCGAGCGTTATCCGGTGAGGCAGAAATATTACCCTAACCATAGGTACACCCCCAAAACCCAGTCAGTTGGTTGTCGGAGTTCGCTGGGTTCGGTCGGTGAAGGTTTCACCGTCTTTTTCAATAACTTTCCGGAGGGGACTTGGCTGGAAACCCTGGAAAGAAGATTCAGAAATCTTGGGAAGGTAATCGACATTTTTCGTCCAAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793137.1
MSGEWREVRRRGVGPSHPERYPVRQKYYPNHRYTPKTQSVGCRSSLGSVGEGFTVFFNNFPEGTWLETLERRFRNLGKVIDIFRPRKRDIKGKSFGFVRFDKDSDRESILKEMNNIWLGSYKLRAYIPRFERPPLKHSGGFTQSGGFETNIKEKKEAGGIRKIAFKVPLNKRTEGKTFAAALGGKSNNSSEPPADESVGFQPKEEELAWLKSSFTGYVKADFVWDEFEVEINSECAGLLKISTLGGNLVLIQSINQTLVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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