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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003287`

染色体: Chr02 坐标: 54152305-54153570 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003287`
名称	SmilChr02G003287
描述	glucuronoxylan 4-O-methyltransferase 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54152305 - 54153570 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010267`
GeneID	`131010267`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010267`
原始查询	`SmilChr02G003287`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucuronoxylan 4-O-methyltransferase 3
产物	glucuronoxylan 4-O-methyltransferase 3
Arabidopsis	`AT4G09990` (GXM2) glucuronoxylan 4-O-methyltransferase-like protein (DUF579) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826590] identity=58; qcov=1.01; evalue=3.55e-125; confidence=high
Rice	`Os12g0204500` - identity=60.8; qcov=0.797; evalue=9.21e-99; confidence=high
GO	GO:0030775 (glucuronoxylan 4-O-methyltransferase activity); GO:0045492 (xylan biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF21729 (IRX15_IRX15L_GXM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010267

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057793700.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057793700.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793700.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793700.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793700.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54152628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr2:54152642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr2:54152703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B124,B27,C25,C34
`Chr2:54152718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C45
`Chr2:54152821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:54153217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B126,C62,C78
`Chr2:54153255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B26
`Chr2:54153277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793700.1

291 aa

146

291

IRX15_IRX15L_GXM

PF21729 IRX15_IRX15L_GXM 93-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793700.1`	Pfam	`PF21729`	IRX15_IRX15L_GXM	Domain	93	276	1.1e-79	267.0	IRX15/IRX15L/GXM

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937717.1
CTCATTGCTTCAATTCCAAGATTAAATAAAGCTAAACCATATATGCACCTTATATAAAAAATCATAGCTTTCTTGCTTCCCTACCAATTTATCTACAAACTCTCACCTTCAAATCTCCCCTCCCCCCATATCCAATCTCATCATTCAAAACAAAACTTGATTTTCGATTTGATCAAGCATGAGGGAGAAAGCACACTACCATTTCAATCTCAAGACAATCTTGATATGTTTCTTCTTCCTTCTCTTCCTCTTCTTGATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010267
ATGAGGGAGAAAGCACACTACCATTTCAATCTCAAGACAATCTTGATATGTTTCTTCTTCCTTCTCTTCCTCTTCTTGATCCTCCGATCATCTTTCCCCTACTCCCAACACACCCCTCTGTCGACTACTCCGGCAGCCACCCACCCCGAGAATTCGCCACAGAGCTGCCGCCCCTCTCTCCCCAACTCACCACTAACATGCACCAAAATCCCACCTTCCCTAGCCCACGCATTAGTCCACTACGCAACCCTAAACATCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793700.1
MREKAHYHFNLKTILICFFFLLFLFLILRSSFPYSQHTPLSTTPAATHPENSPQSCRPSLPNSPLTCTKIPPSLAHALVHYATLNITPQQTLKEISISLKVLEKKSPCNFLVFGLGHDSLMWTALNHGGRTVFLEEDVEWIAQIKERVPSLEAYHVAYDTKVSQADELLEVATREECRVVSDPRSSKCELALASFPSEVYEVEWDVIMVDAPTGYFEGAPGRMSAIYTAGLMARNRESGESDVFVHDVDRVVEDRFSKAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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