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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003292`

染色体: Chr02 坐标: 54190962-54196234 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003292`
名称	SmilChr02G003292
描述	trimethyltridecatetraene synthase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54190962 - 54196234 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009750`
GeneID	`131009750`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009750`
原始查询	`SmilChr02G003292`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	trimethyltridecatetraene synthase-like
产物	trimethyltridecatetraene synthase-like
Arabidopsis	`AT5G07990` (TT7) Cytochrome P450 superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830693] identity=37.2; qcov=0.708; evalue=2.21e-39; confidence=medium
Rice	`Os09g0441600` - identity=44.8; qcov=0.721; evalue=1.11e-60; confidence=medium
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009750

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057793141.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057793141.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793141.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793141.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54190981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B26
`Chr2:54191034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C42
`Chr2:54191078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B35,B6,C63
`Chr2:54191114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B8,B84,C63
`Chr2:54191115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B8,B84,C33,C63
`Chr2:54191332`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B17,C65
`Chr2:54191332`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B17,C65
`Chr2:54191357`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C48,C87
`Chr2:54191357`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C48,C87
`Chr2:54191387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:54191405`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	93	A1,A11,A13,A14,A2,A20,A21,A24,A5,A7,B102,B103,B104,B11,B110,B111,B112,B115,B117,B124,B126,B13,B131,B132,B133,B135,B138,B139,B2,B27,B3,B30,B32,B35,B38,B39,B4,B42,B43,B45,B49,B53,B57,B6,B64,B65,B67,B68,B71,B73,B79,B82,B83,B87,B88,B9,B90,B92,B93,B97,C1,C12,C13,C16,C21,C25,C27,C3,C30,C34,C36,C4,C43,C45,C46,C50,C51,C53,C54,C55,C58,C59,C62,C63,C67,C71,C73,C78,C81,C83,C84,D11,D3
`Chr2:54191637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793141.1

319 aa

160

319

p450

PF00067 p450 84-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793141.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	84	303	6.1e-20	72.2	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937158.1
ATGGAGATCAATGGTGTTATGAATTATGATCATACGGCTATTGGAGATCATATCGTGGATTTTTTCTCTTCTTTGTTTTCGACTAGCAGCCATACTAATACTGATATTACGGCGGTGGAGGCGGTGATTGAGGAGATGGTTGAAAATCGTTATAATAATTTGCTCATTCGCTTGCCGGATGAAGAGGAAATTTCTGCTGTGGTTTTTCAGATGGAGCCGAACAGCTCGCCAGGGCCGGATGGTTTCTCGGTTTTGGTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009750
ATGGAGATCAATGGTGTTATGAATTATGATCATACGGCTATTGGAGATCATATCGTGGATTTTTTCTCTTCTTTGTTTTCGACTAGCAGCCATACTAATACTGATATTACGGCGGTGGAGGCGGTGATTGAGGAGATGGTTGAAAATCGTTATAATAATTTGCTCATTCGCTTGCCGGATGAAGAGGAAATTTCTGCTGTGGTTTTTCAGATGGAGCCGAACAGCTCGCCAGGGCCGGATGGTTTCTCGGTTTTGGTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793141.1
MEINGVMNYDHTAIGDHIVDFFSSLFSTSSHTNTDITAVEAVIEEMVENRYNNLLIRLPDEEEISAVVFQMEPNSSPGPDGFSVLVASSPEMARQFLKVHDAAFASRPAFAAYRHISFDYSDVSFAPYGHYWRVARKIVVTKVLCARKIDSFEHTRVEERRRLLSRLRSLSGKPVELREHLSHFTLSIICKMLFKDESIVDMDEVGVMVREWFLLNGAFNIGDWIPWLDSLDLQGYVKKMKALRKKMDTFCDYVIDDHLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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