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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003295`

染色体: Chr02 坐标: 54225546-54227427 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003295`
名称	SmilChr02G003295
描述	uncharacterized SmilChr02G003295
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54225546 - 54227427 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009751`
GeneID	`131009751`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009751`
原始查询	`SmilChr02G003295`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=24; qcov=0.832; evalue=4.57e-29; confidence=weak
Rice	`Os06g0704400` - identity=31.6; qcov=0.979; evalue=7.54e-67; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009751

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793143.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793143.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793143.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793143.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793143.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54225606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C74
`Chr2:54225624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B66,B72,C74
`Chr2:54225627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr2:54225645`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C47
`Chr2:54225645`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C47
`Chr2:54225668`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A16,B101,B125,B129,B17,B32,B54,C15,C26,C43,C44,C48,C65,D10,D7
`Chr2:54225671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B2,B46,C85,D9
`Chr2:54225775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B93,C48,D10
`Chr2:54225777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A8,B66
`Chr2:54225777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B66
`Chr2:54225831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B94,C77,D4,D5
`Chr2:54225884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793143.1

530 aa

265

530

SWIM

PF04434 SWIM 308-335 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793143.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	308	335	2.3e-08	34.1	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937160.1
ATGGTGGAGGAGTTGAGAAGTGATGTCAAAAGAAGGTTCAATATTGCTATTCCTAATGGCAGATTATATAGGGCTAAGGCTTATGCTCTGGAGACACTGAAAGGATCAGTGACTGGCCACTATGCAAAGCTGAGGAGTTGTATATCTGAGCTTATGAAAGTTGACAGAGAAGGGAGATTTGAATTACTGGTAGGGGATGGTACAATATTTAAAGGGTTGTATATAGATTTTAGTGCTCTGAAAAAGGGATTTGTGGAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009751
ATGGTGGAGGAGTTGAGAAGTGATGTCAAAAGAAGGTTCAATATTGCTATTCCTAATGGCAGATTATATAGGGCTAAGGCTTATGCTCTGGAGACACTGAAAGGATCAGTGACTGGCCACTATGCAAAGCTGAGGAGTTGTATATCTGAGCTTATGAAAGTTGACAGAGAAGGGAGATTTGAATTACTGGTAGGGGATGGTACAATATTTAAAGGGTTGTATATAGATTTTAGTGCTCTGAAAAAGGGATTTGTGGAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793143.1
MVEELRSDVKRRFNIAIPNGRLYRAKAYALETLKGSVTGHYAKLRSCISELMKVDREGRFELLVGDGTIFKGLYIDFSALKKGFVEGCRPIIGLDGCFLKTHLGGQLLCAIGKNGINQMYPIAWAVVEVENEMVQVTNSYRINKSVTYTDGSGYIYLHYSVIEFVVGFDKCCVRSSYKEEWDASMDKLKAENMMAYENFIERDPSRFCKAFISTACVSDMVDNNVSETFNGYILNARGKHIIDMLEEIRSDLRERQFKKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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