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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003297`

染色体: Chr02 坐标: 54243482-54245366 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003297`
名称	SmilChr02G003297
描述	trimethyltridecatetraene synthase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54243482 - 54245366 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010276`
GeneID	`131010276`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010276`
原始查询	`SmilChr02G003297`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	trimethyltridecatetraene synthase-like
产物	trimethyltridecatetraene synthase-like
Arabidopsis	`AT5G07990` (TT7) Cytochrome P450 superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830693] identity=39.4; qcov=1.01; evalue=7.82e-123; confidence=medium
Rice	`Os09g0441100` - identity=50.2; qcov=0.974; evalue=2.96e-177; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010276

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057793710.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057793710.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793710.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793710.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793710.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54243627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B26
`Chr2:54244306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:54244573`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A11,B104,B119,B55,B84,C24,C50
`Chr2:54244579`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A11,A25,B104,B55,B84,C24,C50
`Chr2:54244609`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	28	A11,A25,B104,B119,B129,B138,B14,B140,B2,B35,B38,B50,B51,B55,B59,B71,B84,C2,C24,C27,C38,C39,C50,C59,C77,D10,D11,D7
`Chr2:54244627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr2:54244684`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	54	A11,A25,A5,A9,B104,B106,B112,B120,B123,B129,B136,B138,B14,B140,B2,B29,B35,B38,B50,B51,B55,B59,B63,B69,B73,B84,B90,B97,C11,C13,C14,C2,C24,C27,C30,C32,C37,C38,C39,C43,C46,C47,C50,C59,C69,C73,C74,C77,C83,D1,D10,D11,D2,D7
`Chr2:54244687`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	52	A11,A25,A5,A9,B104,B106,B120,B123,B129,B136,B138,B14,B140,B2,B29,B35,B38,B42,B50,B51,B55,B59,B63,B69,B73,B84,B90,C11,C13,C14,C2,C24,C27,C37,C38,C39,C43,C46,C47,C50,C59,C63,C69,C73,C74,C77,C83,D1,D10,D11,D2,D7
`Chr2:54244700`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	54	A11,A25,A5,A9,B104,B106,B120,B123,B129,B136,B138,B14,B140,B2,B29,B35,B38,B42,B46,B50,B51,B55,B59,B63,B69,B73,B84,B90,B97,C11,C13,C14,C2,C24,C27,C37,C38,C39,C43,C46,C47,C50,C59,C63,C69,C73,C74,C77,C83,D1,D10,D11,D2,D7
`Chr2:54244704`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	54	A11,A25,A5,A9,B104,B106,B120,B123,B129,B136,B138,B14,B140,B2,B29,B35,B38,B42,B46,B50,B51,B55,B59,B63,B69,B73,B84,B90,B97,C11,C13,C14,C2,C24,C27,C37,C38,C39,C43,C46,C47,C50,C59,C63,C69,C73,C74,C77,C83,D1,D10,D11,D2,D7
`Chr2:54244707`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	32	A11,A5,A9,B104,B106,B120,B129,B136,B138,B14,B29,B35,B59,B69,B90,C11,C14,C2,C24,C37,C39,C43,C46,C47,C69,C73,C74,C77,C83,D11,D2,D7
`Chr2:54244805`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A15,A2,A4,B1,B105,B107,B108,B110,B131,B133,B15,B18,B24,B3,B30,B33,B39,B43,B5,B53,B67,B68,B8,B89,B99,C12,C28,C3,C31,C35,C36,C48,C75,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793710.1

501 aa

250

501

p450

PF00067 p450 32-485 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793710.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	32	485	2.5e-94	317.4	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937727.1
GTGAACAAAAAATAAACGCAGTTAAACCCACAACTTCTCTGCAAAACATCCAGCATCACATTTTCACTCACAAATGGAAAATCCCTGGTTACTATTAGCCCTACTTTCCGCTCTTGCAATAGCCTTCATCTCAAAGATAGTATTCAAAACTGATCAAAAACTCGGGCCGCCCGGTCCAAAACCATGGCCTATAATAGGCAATCTGAACCTTCTTGGCTCAATCCCACATCAATCCCTCCACCATTTATCCCAAAAATACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010276
ATGGAAAATCCCTGGTTACTATTAGCCCTACTTTCCGCTCTTGCAATAGCCTTCATCTCAAAGATAGTATTCAAAACTGATCAAAAACTCGGGCCGCCCGGTCCAAAACCATGGCCTATAATAGGCAATCTGAACCTTCTTGGCTCAATCCCACATCAATCCCTCCACCATTTATCCCAAAAATACGGCGAAATAATGTTACTAAAGTTGGGAAAATTTCCAGTGGTGGTGGCATCATCACCCAAGATGGCCGAGCAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793710.1
MENPWLLLALLSALAIAFISKIVFKTDQKLGPPGPKPWPIIGNLNLLGSIPHQSLHHLSQKYGEIMLLKLGKFPVVVASSPKMAEQFLKVHDAAFASRPPALAAGKHISYDNSDVSFSPYGPYWREARKILMSELLGTKKLDQFEQIRVEARRSFFSRLKALSGKPVVLREHLSRYIMSTICRMVMTNEYVGDSSIIDDGGMAEMMRDWFVLTGVFNIGDWIPWLGPLDLQGYVRRMKAFRKKSDSFFGYVIDDHIARRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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