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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003304`

染色体: Chr02 坐标: 54308640-54311391 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003304`
名称	SmilChr02G003304
描述	11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase B
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54308640 - 54311391 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010284`
GeneID	`131010284`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010284`
原始查询	`SmilChr02G003304`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase B
产物	11-beta-hydroxysteroid dehydrogenase B
Arabidopsis	`AT4G10020` (HSD5) hydroxysteroid dehydrogenase 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826593] identity=69.2; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0842900` (OsEnS-59) - identity=67.2; qcov=0.836; evalue=1.93e-155; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010284

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057793716.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057793716.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793716.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793716.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793716.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54308840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,C27,C61,C70
`Chr2:54309674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr2:54309699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,C27,C61,C70
`Chr2:54309840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:54309846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:54310173`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A25,B132,B56,B80,C24,C32,C66,C80,D4
`Chr2:54310175`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A25,B132,B56,B80,C24,C32,C66,C80,D4
`Chr2:54310659`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B4,B42,B67,B95,C2,C4,C68
`Chr2:54310660`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B4,B42,B67,B95,C2,C4,C68
`Chr2:54310669`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B4,B42,B67,B95,C2,C4,C68
`Chr2:54310670`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B4,B42,B67,B95,C4,C68
`Chr2:54310700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793716.1

365 aa

182

365

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 49-238 aa PF08659 KR 51-149 aa PF13561 adh_short_C2 55-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793716.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	49	238	3.3e-37	128.6	short chain dehydrogenase
`XP_057793716.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	51	149	3.8e-06	27.7	KR domain
`XP_057793716.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	55	234	5.4e-22	79.2	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937733.1
TTGTAAATAAGAATTAAATTGATGGAGCTGATTAATAGAGTGTTGAATTTGGTGGCGCCGCCGGCAAGCTTGATGATGCTGGCGTTTGCATGGCCAACTCTCTACTTCATCAGCAGCTGCGAGTGGATTTACAGCACTTATTTCCACAGTGAGGCCATGGAAAATAAGGTCGTCGTCATCACCGGCGCCTCCTCTGGGATCGGAGAGCAAATAGCGTATGAATACGCGAAGAGAGGGGCCAATCTCGTGCTGGTCGCGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010284
ATGGAGCTGATTAATAGAGTGTTGAATTTGGTGGCGCCGCCGGCAAGCTTGATGATGCTGGCGTTTGCATGGCCAACTCTCTACTTCATCAGCAGCTGCGAGTGGATTTACAGCACTTATTTCCACAGTGAGGCCATGGAAAATAAGGTCGTCGTCATCACCGGCGCCTCCTCTGGGATCGGAGAGCAAATAGCGTATGAATACGCGAAGAGAGGGGCCAATCTCGTGCTGGTCGCGCGAAGAGACCATAGGCTACGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793716.1
MELINRVLNLVAPPASLMMLAFAWPTLYFISSCEWIYSTYFHSEAMENKVVVITGASSGIGEQIAYEYAKRGANLVLVARRDHRLRAISENARRFGAAHVLTIAADVVKEDDCRRFINETINCYGRVDHLVNTVTLGHTFYFEEATDSNLFPIIMDINFWGNVYPTYVALPYLRETNGRIVVNTSVENWLPLPRMSLYSAAKSALMNFYETLRFELKDEVGITVATHGWIGAEMRRGKFMMEEGAEMQWKEEREVNVRGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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