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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003306`

染色体: Chr02 坐标: 54325880-54329275 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003306`
名称	SmilChr02G003306
描述	uncharacterized SmilChr02G003306
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54325880 - 54329275 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010286`
GeneID	`131010286`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010286`
原始查询	`SmilChr02G003306`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0242400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os11g0242400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G71500` (AT1G71500) Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843491] identity=78.4; qcov=0.817; evalue=2.07e-121; confidence=high
Rice	`Os11g0242400` - identity=71.4; qcov=0.906; evalue=6.77e-129; confidence=high
GO	GO:0008942 (nitrite reductase [NAD(P)H] activity); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding)
KEGG	-
Pfam	PF00355 (Rieske); PF13806 (Rieske_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010286

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057793719.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057793719.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057793719.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793719.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793719.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54326308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr2:54326857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B89,C1,C85
`Chr2:54328822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C14,C83
`Chr2:54328914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B124,B27,C25,C86
`Chr2:54329021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B6,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793719.1

278 aa

139

278

Rieske

Rieske_2

PF00355 Rieske 71-157 aa PF13806 Rieske_2 71-183 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793719.1`	Pfam	`PF00355`	Rieske	Domain	71	157	3.9e-05	24.2	Rieske [2Fe-2S] domain
`XP_057793719.1`	Pfam	`PF13806`	Rieske_2	Domain	71	183	1.3e-20	74.0	Rieske-like [2Fe-2S] domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937736.1
TAAATAATTTGAGAAGCATACATGAATTACGTGGCAATATCAATATTTGTGTGGCCATGAAATCCTATAGCTCTCCATCAACACTCAACGCGCCTCCTCCCACCTCCCATAACCACCAATTATGGCCACCGCGGCACCTAAATTCACCACCACCGGAGTTTCCTCCGCCGCCCAATTGCCCTTCCGCCGCCGCAGTCCACCAGCTCACCACCACTTTTCGGCAAAGCCAACGTCCAGGATTCCTCTAACATGCTCCCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010286
ATGGCCACCGCGGCACCTAAATTCACCACCACCGGAGTTTCCTCCGCCGCCCAATTGCCCTTCCGCCGCCGCAGTCCACCAGCTCACCACCACTTTTCGGCAAAGCCAACGTCCAGGATTCCTCTAACATGCTCCCCTAGCAGAGTTAGTGTCATCAAATGCAAGGCCACCGAGGTCTCGCCGTCGCCAGTGGCGGCGGAGGACGGGAAGAACTGGGTGCCTGTGGTGCCGCTGGCGGCACTGCCCAAGGGGGAGCGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793719.1
MATAAPKFTTTGVSSAAQLPFRRRSPPAHHHFSAKPTSRIPLTCSPSRVSVIKCKATEVSPSPVAAEDGKNWVPVVPLAALPKGERRVIIQDGETILLLWYKNDVFAIENRSPAEGAYSEGLLNAKLTQDGCIICPTTDSTFSLETGEIKEWYPKNPVLRALTPPLRGLFIYPVKTDDNNIYINMRGSTPSDASTEIVFSGKAQPGFTSVDVNVDEVRMIVDEDFEGFGFTGKNELINGKAAVIGFLLLLDFELLTGKGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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