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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003316`

染色体: Chr02 坐标: 54408101-54411726 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003316`
名称	SmilChr02G003316
描述	transcription factor bHLH25-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54408101 - 54411726 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010295`
GeneID	`131010295`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010295`
原始查询	`SmilChr02G003316`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH25-like
产物	transcription factor bHLH25-like
Arabidopsis	`AT4G37850` (AT4G37850) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829941] identity=41; qcov=0.648; evalue=3.64e-34; confidence=medium
Rice	`Os03g0725800` (OsbHLH018) - identity=41.7; qcov=0.597; evalue=9.85e-35; confidence=medium
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF22754 (bHLH-TF_ACT-like_plant)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010295

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793730.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793730.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793730.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793730.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793730.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54410366`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B56,B96
`Chr2:54410366`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr2:54410371`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B56,B96
`Chr2:54410371`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr2:54410403`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B56,B96
`Chr2:54410403`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr2:54410409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B103,B115,B8,C45
`Chr2:54410413`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B56,B96
`Chr2:54410413`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr2:54411039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C65
`Chr2:54411151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B122,B82,C60
`Chr2:54411314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793730.1

293 aa

146

293

HLH

bHLH-TF_ACT-like_plant

PF00010 HLH 139-184 aa PF22754 bHLH-TF_ACT-like_plant 218-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793730.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	139	184	8.2e-10	39.1	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057793730.1`	Pfam	`PF22754`	bHLH-TF_ACT-like_plant	Domain	218	289	1.9e-06	28.6	Plant bHLH transcription factor, ACT-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937747.1
GTAAGAAGACGGTTCACACGTGTGTGAGTATACAAATCTTCGCACACGTAAACCACAATATATATATATATATATACATATATATCTCCGACCATTTCATCAGACCAAGAATTTAATCTGTCCGAAGCTCAGTTCAGTGGGTGTGTGTGGGGAGAGAGAGAGAGGTTATCCTCTCAAGTAGACAAGAACAAGAGAAGAATTTTGAGAGCTTTTCTGTCGCGATAAATTAACTTAATTTAATTTCTTATTATATATTCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010295
ATGGAAATATTGGAAGACGATTTTTTCTATCTCAACCCTTTTCTCGCTGAGATCTACTCCAACTGCAGCAACAGCGGCAGCTCCCAGACTTCCGATCACGGCGGTGCCGCCGATCAGCTGAGAATGAGTTCAACGAGCTGGATTAATTCATTGAACGGTCGAGAAATGGCGATGCCGAGTTCTTCAATAATGGCAGCTGCTGTTGAAGCTCCACAGTTAATTTCTTTTGAGAACGAGAGATTTTCGTCGTTTTCTCCGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793730.1
MEILEDDFFYLNPFLAEIYSNCSNSGSSQTSDHGGAADQLRMSSTSWINSLNGREMAMPSSSIMAAAVEAPQLISFENERFSSFSPTNADHRSTDCNNLTPQIISFSSSTKDDDDDGDFGGKRERASTATRTPLQAQDHLMAERKRREDLRHLFIALSKVVPGLKKLDKASLLEDAINHLKSLEERVKVLEKEAMMSPREDISNSGCESVPVEISARVREKHVLIKMCCKKQMGLMSRIPCEMEKLHLNVVDIRIMPFGQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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