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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003321`

染色体: Chr02 坐标: 54466638-54472850 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003321`
名称	SmilChr02G003321
描述	tubulin-folding cofactor E
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54466638 - 54472850 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010301`
GeneID	`131010301`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010301`
原始查询	`SmilChr02G003321`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tubulin-folding cofactor E
产物	tubulin-folding cofactor E
Arabidopsis	`AT1G71440` (PFI) tubulin folding cofactor E / Pfifferling (PFI) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843485] identity=61.6; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0105300` - identity=55.8; qcov=0.312; evalue=1.48e-60; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01302 (CAP_GLY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010301

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793739.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057793739.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057793739.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793739.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793739.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54466931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:54467028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,C29,C40,C74,C86
`Chr2:54467140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B112,B25,B44,C24
`Chr2:54468483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C55
`Chr2:54468526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:54469590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:54472068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B34,B59,C33
`Chr2:54472546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:54472557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793739.1

551 aa

276

551

CAP_GLY

PF01302 CAP_GLY 22-89 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793739.1`	Pfam	`PF01302`	CAP_GLY	Domain	22	89	8.4e-18	64.8	CAP-Gly domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937756.1
AGCCTCGATCGACGATCGTTTGCCACAATTTAAACTTTCGACAAAGTTGGAGTTTTCAAAACTTGATGTTATAACCCATTTGACATATCTACAAATTAGAGGGGTCGAAACATAAATAAAGAACGTTGAGTTTTAAACAAAAAAACTTAAAATTATTGAGTCATCAGTCATATCACTTGCACTCTTCTCCAACTGCAGATGCACACCACCGCCAACTCCAGCAATCCGACCGGGAAGCTCGATGCCGGAAAAATTTTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010301
ATGCACACCACCGCCAACTCCAGCAATCCGACCGGGAAGCTCGATGCCGGAAAAATTTTCCGGCTCGGGCAGCGGGTCCACTTCACCGGGCAGCCGAGAAGAGTCGGAACGGTCGGGTACGTGGGGGCCGTGGAGGGTTACGGCGGTGATTGGGTCGGAGTCGATTGGGACGCCGACGGAGAAGGCAAGCACGACGGATCCCACAATGGCGTCAGATACTTCACGGCGAGAGGCCCCGATACGGCGTCGTTCGTGCGGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793739.1
MHTTANSSNPTGKLDAGKIFRLGQRVHFTGQPRRVGTVGYVGAVEGYGGDWVGVDWDADGEGKHDGSHNGVRYFTARGPDTASFVRSHNLSSGVSLLEALQTRYRAQTTKEELDEMYVLSARNKKVSIELLGKHKIEDKFSRFEELTSASLSYLGVSFPGSPDHISSTLPNLKELDLTGNLLADWNDISIICEGLPALTALNLSNNSMSHAILSTPRLSNIRILVLNQTGVVWDQMEALKDALPHMEELHLMGNKLREIT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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