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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003324`

染色体: Chr02 坐标: 54514246-54518177 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003324`
名称	SmilChr02G003324
描述	succinate dehydrogenase assembly factor 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54514246 - 54518177 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010384`
GeneID	`131010384`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010384`
原始查询	`SmilChr02G003324`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	succinate dehydrogenase assembly factor 1, mitochondrial
产物	succinate dehydrogenase assembly factor 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT2G39725` (AT2G39725) LYR family of Fe/S cluster biosis protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818557] identity=65.2; qcov=0.958; evalue=4.41e-36; confidence=medium
Rice	`Os08g0278600` (P0026A08.1-1) - identity=64.7; qcov=0.885; evalue=7.81e-38; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0034553 (mitochondrial respiratory chain complex II assembly)
KEGG	-
Pfam	PF05347 (Complex1_LYR); PF13233 (Complex1_LYR_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010384

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057793869.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057793869.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793869.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793869.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793869.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54514524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B52,B98,C55,C63
`Chr2:54514536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:54514554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B21,B52,C14,C55
`Chr2:54514565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr2:54514599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B52,B98,C55,C63
`Chr2:54514648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C35
`Chr2:54514664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B52,B98,C55,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793869.1

96 aa

Complex1_LYR

Complex1_LYR_2

PF05347 Complex1_LYR 15-74 aa PF13233 Complex1_LYR_2 16-75 aa

XP_057793870.1

96 aa

Complex1_LYR

Complex1_LYR_2

PF05347 Complex1_LYR 15-74 aa PF13233 Complex1_LYR_2 16-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793869.1`	Pfam	`PF05347`	Complex1_LYR	Family	15	74	1.3e-11	45.0	Complex 1 protein (LYR family)
`XP_057793869.1`	Pfam	`PF13233`	Complex1_LYR_2	Family	16	75	2.6e-05	25.5	Complex1_LYR-like
`XP_057793870.1`	Pfam	`PF05347`	Complex1_LYR	Family	15	74	1.3e-11	45.0	Complex 1 protein (LYR family)
`XP_057793870.1`	Pfam	`PF13233`	Complex1_LYR_2	Family	16	75	2.6e-05	25.5	Complex1_LYR-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937887.1
TCAGCCTTCTTCTGCGGCTTCTACGTTTAGCCGACATCCCACCGGCCACCGGCGCTCCTGTGCTCAGCCTTCTTCTGTGGCTTCTGCTTCTGCGTTCAGCCCGGCAGCTGCCTCCCAGTCCCGCACGCCGGCCACACCAGCACGGCGACGGCGTGTCTCCGGCGGCCTGAAGATCAGTGACCTTCTTTGGCTCAAGTTGAGATTATTTACAGAAGGCGAAGCTGCGGAAAACAAACTAGCCGGAGATGCAATGGGAGCTT...

XM_057937886.1
CGAAAATGGTAACTACCTGCAACTCTGCAAGCATTCTACACTCGTTATACCATTTCACCACTCTCCCTCTGTTCGCTCTTCCACAAAATGGGCGAAAATTGGCAATAACCCAAAACTCCTCTGCGCTTGACTGCGTTCAACACCACCATTCTCTCACCTCTGTCTTCTCCAGCCAACCCGCCACAACCGCCCTGTGTGCGCTGAAATCCTCAATAACTGGGAGGCAGCCGATTCTGCTAGTTCCAGCTTTCCAATATCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010384
ATGGGAGCTTCCACTAAACCAAGGCTTTCAGGAATGCAGTTGCAAGTCCTTGCCCTGTACAGAGGGTTCTTACGAGCAGCTCGCACAAAATCCCCTGAAGAACGTAGCAGAATCGAAGCACTTGTGTCTCAGGAGTTCCGTCGGAATTCCTCACAGGTTGACCGGAAGAACTACCTCTACATCGAGTATTTAGTTCGGCGTGGAAAGAAGCAGCTTGATCAGCTAAAGAGCCCGGAAACTGTTGGATTGGCTTCCTTAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057793869.1
MGASTKPRLSGMQLQVLALYRGFLRAARTKSPEERSRIEALVSQEFRRNSSQVDRKNYLYIEYLVRRGKKQLDQLKSPETVGLASLNVEASQVKRS

XP_057793870.1
MGASTKPRLSGMQLQVLALYRGFLRAARTKSPEERSRIEALVSQEFRRNSSQVDRKNYLYIEYLVRRGKKQLDQLKSPETVGLASLNVEASQVKRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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