当前解析结果
SmilChr02G003330| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003330 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003330 |
| 描述 | molybdopterin synthase sulfur carrier subunit |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 54553101 - 54554708 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131010385 |
|---|---|
| GeneID | 131010385 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131010385 |
| 原始查询 | SmilChr02G003330 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | molybdopterin synthase sulfur carrier subunit |
| 产物 | molybdopterin synthase sulfur carrier subunit |
| Arabidopsis | AT4G10100 (CNX7)co-factor for nitrate, reductase and xanthine dehydrogenase 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826601] identity=57.3; qcov=1; evalue=3.39e-36; confidence=medium |
| Rice | Os02g0558300- identity=65.8; qcov=0.792; evalue=1.63e-29; confidence=medium |
| GO | GO:0005829 (cytosol); GO:0006777 (Mo-molybdopterin cofactor biosynthetic process) |
| KEGG | smil04122 (Sulfur relay system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF02597 (ThiS) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131010385 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057793871.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057793871.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057793871.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793871.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793871.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057793871.1PF02597
ThiS 20-96 aa
XP_057793872.1PF02597
ThiS 20-96 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057793871.1 |
Pfam | PF02597 |
ThiS | Domain | 20 | 96 | 1.7e-14 | 54.8 | ThiS family |
XP_057793872.1 |
Pfam | PF02597 |
ThiS | Domain | 20 | 96 | 1.7e-14 | 54.8 | ThiS family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。