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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003347`

染色体: Chr02 坐标: 54682251-54684804 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003347`
名称	SmilChr02G003347
描述	uncharacterized SmilChr02G003347
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54682251 - 54684804 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010373`
GeneID	`131010373`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010373`
原始查询	`SmilChr02G003347`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840243]; symbol=AT1G33490; hit=AT1G33490; species=arabidopsis; confidence=high
产物	E3 ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840243]; symbol=AT1G33490; hit=AT1G33490; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G33490` (AT1G33490) E3 ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840243] identity=72.6; qcov=0.841; evalue=8.23e-81; confidence=high
Rice	`Os05g0105500` - identity=66.9; qcov=0.821; evalue=1.39e-77; confidence=high
GO	GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	-
Pfam	PF09835 (DUF2062)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010373

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057793855.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057793855.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793855.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793855.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793855.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54682679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C87
`Chr2:54683510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B26
`Chr2:54683564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B53,B71,C45
`Chr2:54684475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B37,B40,D3
`Chr2:54684517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr2:54684518`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B118
`Chr2:54684518`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B118
`Chr2:54684561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793855.1

195 aa

195

DUF2062

PF09835 DUF2062 22-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793855.1`	Pfam	`PF09835`	DUF2062	Family	22	158	5.4e-09	36.9	Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2062)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937872.1
CTTACTCTCTCTAAAAAAAAATCAATTAAATGATGTTCTTATATGGGAGTATGTTTTGGTGGGACAAGCAACGAAAGGAATAACCGGTGGTTGAGACGACGTCGTTAAGGCTCTGATCTCCATAAGAAGGCAGCAGCAGGAATCCATCAATTCTCCCTGATCCGCAGCTCACCCCATAAACAAGGATTCATTACTCAACCAAAATCACACAACGATGGCGAAACGCTTTGGATTTGGATTTTTGGTCTCATGGTTCCGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010373
ATGGCGAAACGCTTTGGATTTGGATTTTTGGTCTCATGGTTCCGTAAAAAAATTGTGGACCCTCTTCACCAAATCCTTCGCCGGGGAGCCGAGCCCAAGCAGCTGTCATTCTCCGCTGCGCTCGGAATCACCTTAGGACTCTTTCCCATCTGTGGGGTTACTGTGTTTTTATGCGGGTTAGCTATTGCGGTACTTGGATCCCATTGTCATGCTCCAACTGTAATGCTGACTAACTTTATTGCTACTCCGATTGAGTTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793855.1
MAKRFGFGFLVSWFRKKIVDPLHQILRRGAEPKQLSFSAALGITLGLFPICGVTVFLCGLAIAVLGSHCHAPTVMLTNFIATPIELSLMIPFLRFGEFITGGPHFALTSDALKKVVTGKASWEVLQSIFHALLGWLVAAPFIFGGLYVLCLPCFKMLVYRFAVVPSSPKKPITSISSPRKSPNSPSEVRLKVRDV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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