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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003352`

染色体: Chr02 坐标: 54710558-54711911 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003352`
名称	SmilChr02G003352
描述	DNA repair RAD52-like protein 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54710558 - 54711911 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010371`
GeneID	`131010371`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010371`
原始查询	`SmilChr02G003352`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA repair RAD52-like protein 1, mitochondrial
产物	DNA repair RAD52-like protein 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G71310` (RAD52-1) cobalt ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843472] identity=70.3; qcov=0.767; evalue=1.03e-71; confidence=high
Rice	`Os03g0851500` (OsRad52-2a) - identity=49.2; qcov=0.711; evalue=1.07e-40; confidence=medium
GO	GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF04098 (Rad52_Rad22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010371

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057793852.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057793851.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057793851.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057793852.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793852.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54710657`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B94
`Chr2:54710657`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B94
`Chr2:54710729`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A24,B106,B108,B112,B114,B3,B38,B39,B5,B73,B97,C13,C30,C59,C83,C84
`Chr2:54710774`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	B123,B137,B139,B29,B30,B37,B4,B51,B6,B62,B66,B72,B97,C35,C37,C4,C52,C67,D3
`Chr2:54710904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C29,C6
`Chr2:54710904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C6
`Chr2:54711597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:54711634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793852.1

180 aa

180

Rad52_Rad22

PF04098 Rad52_Rad22 58-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793852.1`	Pfam	`PF04098`	Rad52_Rad22	Family	58	178	0.00026	21.7	Rad52/22 family double-strand break repair protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937868.1
CAATAAAAATGCGGCCCAAAATGTTTTTATTGCTCCAAAATTGAAAAAGACCTAAAGAAGCAACAGCTTGAAGTTGGAAGTGAAGAGATCAAACATGGGCAGCAGAAGGTCCATCTCAAAAATCGGTCAAGCTTACTGCTTTGAATTTCAACGCCGTCGTTTTTCCTCAAAGCCCTCTTACCCTTCTTCCGCGAAGGCGCACCCGCAAGTGGCCAGTGACGACGATGACGCCGCCGTGCCGACCGCCGGAATAAGTAGGC...

XM_057937869.1
GGTGTTGCCAACTTGCACAACAATAAAAATGCGGCCCAAAATGTTTTTATTGCTCCAAAATTGAAAAAGACCTAAAGAAGCAACAGCTTGAAGTTGGAAGTGAAGAGATCAAACATGGGCAGCAGAAGGTCCATCTCAAAAATCGGTCAAGCTTACTGCTTTGAATTTCAACGCCGTCGTTTTTCCTCAAAGCCCTCTTACCCTTCTTCCGCGAAGGCGCACCCGCAAGTGGCCAGTGACGACGATGACGCCGCCGTGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010371
ATGGGCAGCAGAAGGTCCATCTCAAAAATCGGTCAAGCTTACTGCTTTGAATTTCAACGCCGTCGTTTTTCCTCAAAGCCCTCTTACCCTTCTTCCGCGAAGGCGCACCCGCAAGTGGCCAGTGACGACGATGACGCCGCCGTGCCGACCGCCGGAATAAGTAGGCCCCTCTCCGAAATTCTCAAGGACTTGAACAAAAAGGTTCCCGATTCCCTTATCAAATCTCGCACAGAAGCCTCTGACTTTTCTCTGAGATACGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057793851.1
MGSRRSISKIGQAYCFEFQRRRFSSKPSYPSSAKAHPQVASDDDDAAVPTAGISRPLSEILKDLNKKVPDSLIKSRTEASDFSLRYVPWHILNRILNLHAPGENGLVRSVASLILLMPLLYPLCIVSHFMELMQRSSEKQQAALQLATQAMGVLCKRQKQWHFVELVLALAWDFIFIIKNWNDLSMFIFTWITYHVCQHLLASICNPLSTLSSRLVLLQVNLAHFVCEFM

XP_057793852.1
MGSRRSISKIGQAYCFEFQRRRFSSKPSYPSSAKAHPQVASDDDDAAVPTAGISRPLSEILKDLNKKVPDSLIKSRTEASDFSLRYVPWHILNRILNLHAPEWSGEVRSITYSADATSVSVVYRVTLYGTDAEIFREATGSASVSDTSYGGPVQKAEAMAFRRACARLGLGLHLYHQELE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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