当前解析结果
SmilChr02G003369| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003369 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003369 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G003369 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 54812407 - 54818279 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131010381 |
|---|---|
| GeneID | 131010381 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131010381 |
| 原始查询 | SmilChr02G003369 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0127000; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os03g0127000; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT1G30845 (AT1G30845)cell growth defect protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839968] identity=65.9; qcov=0.934; evalue=1.06e-25; confidence=medium |
| Rice | Os03g0127000- identity=69; qcov=0.956; evalue=1.33e-31; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131010381 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 1.00000 | XP_057793864.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057793865.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057793864.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793864.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793864.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:54816844 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B95 |
Chr2:54816844 |
CA |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr2:54816866 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C86 |
Chr2:54816974 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,C71 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。