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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003380`

染色体: Chr02 坐标: 54921667-54927229 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003380`
名称	SmilChr02G003380
描述	probable 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54921667 - 54927229 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010347`
GeneID	`131010347`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010347`
原始查询	`SmilChr02G003380`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase
产物	probable 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase
Arabidopsis	`AT4G24160` (AT4G24160) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828516] identity=81.3; qcov=0.904; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0520200` - identity=84.2; qcov=0.902; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004623 (A2-type glycerophospholipase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010347

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057793816.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057793816.1`
3	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057793816.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057793816.1`
5	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057793816.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54922455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C28
`Chr2:54923210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:54923364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:54924370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C83
`Chr2:54926930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C34
`Chr2:54926999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B70
`Chr2:54926999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793816.1

408 aa

204

408

Abhydrolase_1

Hydrolase_4

Abhydrolase_6

PF00561 Abhydrolase_1 112-377 aa PF12146 Hydrolase_4 113-375 aa PF12697 Abhydrolase_6 114-381 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793816.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	112	377	7.8e-29	101.8	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057793816.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	113	375	1.1e-20	74.7	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057793816.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	114	381	3.7e-21	77.5	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937833.1
TATTTCAACTCTTTGATCCATTTAAAAATAAAAGACTTGGTTGACAAGTATGGCGTATGAAATGGGCTCATGCGGCTTCGAATCTCATCTCAACAAAATCAATGCCAATGGAAACACCCACCGACCTTCCCAGACTCCATTCTATCCTTCTTTCTACCTAGTCAAAAATTATAGCTCTCATATTATTTATTCATACACATACGCGCTCGAATAATTGTAGAATATCTTCAATTTCGTTTATTCGTTTCAGTTTTCCGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010347
ATGAGAATTGGCCTGCGACGTTGGTCCAAATTGCCGCGAGATTTAGTTAGCAAAATGTCGGAGGAAATCAGCTCATCCGCAGCAACCACCACGGCTGCGGCGGCGGCGAAGAGGCGCTCGCTCTGGCCCTCCGTTTTGCGGTGGATACCGACCTCCACCGACCACATCATCGCTTCCGAAAAACGCCTGCTCTCTGTCGTCAAAACGCCTTATGTGCAGGAGCAGGTCAATATTGGGTCGGGTCCGCCGGGTTCGAGAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793816.1
MRIGLRRWSKLPRDLVSKMSEEISSSAATTTAAAAAKRRSLWPSVLRWIPTSTDHIIASEKRLLSVVKTPYVQEQVNIGSGPPGSRVRWFRSASDEPRFINTVTFDGKEGAPTLVMVHGYGASQGFFFRNFDALAARFKVVAIDQLGWGGSSRPDFTCKSTEETEAWFIDSFEEWRKAKNLSNFVLLGHSFGGYVAAKYALKHPEHVQHLILVGPAGFTSETEHRSEWLTRFRATWKGAILNHLWESNFTPQKIVRGLGP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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