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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003381`

染色体: Chr02 坐标: 54927687-54930592 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003381`
名称	SmilChr02G003381
描述	uncharacterized SmilChr02G003381
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54927687 - 54930592 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010366`
GeneID	`131010366`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010366`
原始查询	`SmilChr02G003381`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=30.9; qcov=0.81; evalue=3.96e-25; confidence=low
Rice	`Os11g0577650` - identity=49.7; qcov=0.75; evalue=6.36e-61; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010366

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793845.1`
2	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057793845.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057793845.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793845.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793845.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54928751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:54928786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr2:54928840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:54928842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C55
`Chr2:54928842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr2:54928848`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C83
`Chr2:54928848`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C83
`Chr2:54928911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,B46
`Chr2:54928942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B82,C1,C41,C8
`Chr2:54928968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:54928978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:54928986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B100,B15,B2,B31,B35,B48,B63,B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793845.1

252 aa

126

252

DUF8040

PF26138 DUF8040 72-150 aa

XP_057793846.1

252 aa

126

252

DUF8040

PF26138 DUF8040 72-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793845.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	72	150	8e-20	71.2	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057793846.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	72	150	8e-20	71.2	Domain of unknown function (DUF8040)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937863.1
CTTAGTTCTTTCTAGATTACGAAACCAGCAAAGGGGATCGGGTACAGTGTCTGAGATGCTATATTACCTTAGACCAAAAATTCGAATTTCAATATTAAACTAGTGTTATCCCTTGTAGACTCTCCATTGGCAGCGAACATGTTGGGATCCTCAATTAGCCCTCGTGTGAGCTTCATTTGCCTCGTCAAATCCCTAAGGCAGCTAATTTTTTATTGAGTGAAGGTGAGGGTGTAATTCCTTTTTTAATTACTCACTATATA...

XM_057937862.1
GGAGCTTCGATTATTTTCATAGAATTATGTAAATTATCATTTTCACAAATCGATTTCTCCAACGCAATTGAAATTTCTATGCCTTGTGTTGTTGGTTTCAATCTCTAGGGGGGTTTTTTTTGTTGCCTGAGTTCTTCGTTGGGATCCTCAATTAGCCCTCGTGTGAGCTTCATTTGCCTCGTCAAATCCCTAAGGCAGCTAATTTTTTATTGAGTGAAGGTGAGGGTGTAATTCCTTTTTTAATTACTCACTATATATCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010366
ATGAGAAACAGCAGAACTAATCATATGACACATGTGTCGTGGTTAATTGAGGACATAATGCGTCAATTTTTATTTCAACTTGTAGTAATAATCGAGGTACTTATTAAAAAGAATACACGAAAGCAAAAATGCAATGATTCAATCGAGCCATATGCTATGTTGTGTAAGATTCTCGACCAAATTAAACACCTAAGTAGAATGACGAGTGTCAGTGATACAAACAATATTGTAAACCTTAAGATGGATCGCAACACGTTTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057793845.1
MRNSRTNHMTHVSWLIEDIMRQFLFQLVVIIEVLIKKNTRKQKCNDSIEPYAMLCKILDQIKHLSRMTSVSDTNNIVNLKMDRNTFGRLCNLFRQLGSLEDGRYVSVEEQVAMFLSILAHHKKNRVVWFDFWRSGQKISYYVHTVSKAILKLHVILLVKPDPVPEECDDPRWKWFKGCLGALDGTYINVLVSNSDKPRYKTRKGQIATNTLGVYDRNMKFVYALPGWEESAANSRILRYALNRPHRLRVPWD

XP_057793846.1
MRNSRTNHMTHVSWLIEDIMRQFLFQLVVIIEVLIKKNTRKQKCNDSIEPYAMLCKILDQIKHLSRMTSVSDTNNIVNLKMDRNTFGRLCNLFRQLGSLEDGRYVSVEEQVAMFLSILAHHKKNRVVWFDFWRSGQKISYYVHTVSKAILKLHVILLVKPDPVPEECDDPRWKWFKGCLGALDGTYINVLVSNSDKPRYKTRKGQIATNTLGVYDRNMKFVYALPGWEESAANSRILRYALNRPHRLRVPWD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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