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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003400`

染色体: Chr02 坐标: 55140322-55146455 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003400`
名称	SmilChr02G003400
描述	probable GTP-binding protein OBGC2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55140322 - 55146455 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010335`
GeneID	`131010335`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010335`
原始查询	`SmilChr02G003400`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable GTP-binding protein OBGC2
产物	probable GTP-binding protein OBGC2
Arabidopsis	`AT5G18570` (EMB269) GTP1/OBG family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831975] identity=36.1; qcov=0.743; evalue=4.26e-47; confidence=medium
Rice	`Os03g0799700` (TSV3) - identity=63.7; qcov=0.913; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005739 (mitochondrion)
KEGG	-
Pfam	PF01018 (GTP1_OBG); PF01926 (MMR_HSR1); PF02421 (FeoB_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010335

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057793794.1`
2	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057793794.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793794.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793794.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793794.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55140738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B100
`Chr2:55140738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:55141602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:55141890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C8
`Chr2:55142373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:55144397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B104,B59
`Chr2:55145191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C49,C79,D4,D8
`Chr2:55145324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:55145392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:55145446`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	93	A1,A16,A19,A21,A23,A24,A7,A8,A9,B1,B102,B104,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B118,B12,B120,B130,B135,B14,B16,B18,B2,B20,B22,B24,B25,B26,B30,B31,B32,B37,B4,B44,B45,B48,B49,B53,B54,B57,B59,B68,B71,B73,B80,B83,B86,B88,B89,B94,B98,C1,C12,C15,C18,C19,C22,C24,C26,C37,C41,C42,C45,C47,C49,C50,C51,C55,C58,C59,C6,C64,C66,C7,C70,C71,C79,C8,C85,C87,D10,D11,D3,D4,D8,D9
`Chr2:55145451`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	93	A1,A16,A19,A21,A23,A24,A7,A8,A9,B1,B102,B104,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B118,B12,B120,B130,B135,B14,B16,B18,B2,B20,B22,B24,B25,B26,B30,B31,B32,B37,B4,B44,B45,B48,B49,B53,B54,B57,B59,B68,B71,B73,B80,B83,B86,B88,B89,B94,B98,C1,C12,C15,C18,C19,C22,C24,C26,C37,C41,C42,C45,C47,C49,C50,C51,C55,C58,C59,C6,C64,C66,C7,C70,C71,C79,C8,C85,C87,D10,D11,D3,D4,D8,D9
`Chr2:55146139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793794.1

495 aa

248

495

GTP1_OBG

MMR_HSR1

FeoB_N

PF01018 GTP1_OBG 134-232 aa PF01926 MMR_HSR1 274-401 aa PF02421 FeoB_N 275-436 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793794.1`	Pfam	`PF01018`	GTP1_OBG	Domain	134	232	5.1e-22	78.9	GTP1/OBG
`XP_057793794.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	274	401	2.6e-23	83.0	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057793794.1`	Pfam	`PF02421`	FeoB_N	Domain	275	436	2.5e-07	31.1	Ferrous iron transport protein B

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937811.1
TTTATTTTGTTGTTCCAGCTCGAGTAGCCAATCGTCATCCACTGACTGATCTCAAGCTCTGCTGGAGCTTTTATTTCAATGAGTAATATCTTAAAATTACCCTCTGTAAATTAAATCAAAGATGATCTCAAGGTGAAATCCTTTTGATTACTGAAAAGCCCCAAGAATCATCCTATACTGCATTATCCATCTCTCTTTGGGACACCATCTTGAAGCAAAGGAGAATGCTGTCATCGGTTCCTCAGCAGCGTTCATCTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010335
ATGCTGTCATCGGTTCCTCAGCAGCGTTCATCTTCATCTCTCAACTTGCCGTCTAATACAATTCCGCGGCCTTCCCTCTCTGCTTTCTCATCCCAACTCTTTCATTTCAATAGGAAATTGATTGTCCAAAAGAATTACCAGGGCATTTTGCTTAAGTGTGCACTTGCTAAAGTCAAGAATTCGCCTTCACTAAACCCTGAGATACTGGTCAAGGAACGCCACAAATACTTTGATGAGGTGATCATCACCGTCCGGGCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793794.1
MLSSVPQQRSSSSLNLPSNTIPRPSLSAFSSQLFHFNRKLIVQKNYQGILLKCALAKVKNSPSLNPEILVKERHKYFDEVIITVRAGDGGHGAILTLPNQNGPSKSVGKFDKEKTRKKASYKRDFDGSLILPVGGHGGDVIIYADESKDTLLEFHKKSRYNAKRGGNVDAMGVFSSQSHSGLAGPVLRIPVPLGTVVKHKRGKLLADLAQPGDEVMVAKGGQGGISLLELPEHRRNKMMGLTTNIMRDDSDKVLVVGQPG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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