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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003403`

染色体: Chr02 坐标: 55188001-55196753 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003403`
名称	SmilChr02G003403
描述	nucleobase-ascorbate transporter 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55188001 - 55196753 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010330`
GeneID	`131010330`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010330`
原始查询	`SmilChr02G003403`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleobase-ascorbate transporter 3
产物	nucleobase-ascorbate transporter 3
Arabidopsis	`AT2G26510` (PDE135) Xanthine/uracil permease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817192] identity=71.5; qcov=0.95; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0583900` - identity=65.2; qcov=0.964; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00860 (Xan_ur_permease)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010330

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057793788.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793788.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793788.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793788.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793788.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55192660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr2:55192915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,D4
`Chr2:55193156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B89,D4
`Chr2:55193187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B89,D4
`Chr2:55193193`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B127
`Chr2:55193193`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B127
`Chr2:55193238`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A22
`Chr2:55193238`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A22
`Chr2:55193340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:55193353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,D4
`Chr2:55193518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr2:55193519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B89,D11,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793788.1

557 aa

278

557

Xan_ur_permease

PF00860 Xan_ur_permease 63-467 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793788.1`	Pfam	`PF00860`	Xan_ur_permease	Family	63	467	1.1e-70	239.0	Permease family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937805.1
TCTTTCTCACTCCTCAATCACTAAGCATTTTCTTCTCTTTCACTTATTATATGTCAGAAACAACTACTATAATAATTGGCCTTTATTACCATCCTAAGTCATCTGATCTCTACTAATATTTTCATATTTGAAAAAGCTTCCTAACTTTTAAAATACTCTTGGCCTTTTCAAGATTTTACAGAATACCGCCTCTGGGCTTTGTGCATGTGCTGCCAAAAATAACAATTCATTTGAAAGTGTCGGTGATTAGCAAGGAAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010330
ATGGTGGAAACGGCACATCACAACCACCAGGCGCCGCCGGGTCATGGTCATGGTCATGGTCATGGGGCTCCACCGCCGCCGCCGGTGGTAGCGCCTCCGCTAGGTGCTGCTAGAGGCCCTTTTTACCCTCCAGCAGAGCAGCTCCTTCAGCTCCATTACTGCATCCATTCCAATCCTTCTTGGGTACAAACAGCAGTGCTGGGTTTCCAACATTACATTGTCATGCTTGGAACCACTGTGATGATTGCCACTGCACTAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793788.1
MVETAHHNHQAPPGHGHGHGHGAPPPPPVVAPPLGAARGPFYPPAEQLLQLHYCIHSNPSWVQTAVLGFQHYIVMLGTTVMIATALVPRMGGSPGDKARVIQSLLFMSGVNTLLQTWFGTRLPTVMGPSFSYIISVLAIINDLFDSDFQDDHERFTHTMRAIQGSLIVSSFLNIILGYSNAWGKLTRHFGPIVLVPAVCVVGLGLFSRGFPQLANCVEIGLLMLILLVISQQYLQRLHPIAQPMLERYALLLCVAIVWAF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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