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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003404`

染色体: Chr02 坐标: 55212150-55215283 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003404`
名称	SmilChr02G003404
描述	serpin-ZX-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55212150 - 55215283 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010348`
GeneID	`131010348`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010348`
原始查询	`SmilChr02G003404`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serpin-ZX-like
产物	serpin-ZX-like
Arabidopsis	`AT1G47710` (SERPIN1) Serine protease inhibitor (SERPIN) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841182] identity=63.3; qcov=1; evalue=4.83e-179; confidence=high
Rice	`Os03g0610650` (OsSRP-LRS) - identity=57.9; qcov=1.01; evalue=2.28e-143; confidence=high
GO	GO:0004867 (serine-type endopeptidase inhibitor activity); GO:0005615 (GO:0005615)
KEGG	-
Pfam	PF00079 (Serpin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010348

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057793817.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057793817.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057793817.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057793817.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793817.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55212625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C49,D4
`Chr2:55212681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C26,C87
`Chr2:55212743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B140,B55,C17
`Chr2:55212760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C49,D4
`Chr2:55212868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:55212905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:55213004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,D11
`Chr2:55214854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr2:55214891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr2:55214949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C43
`Chr2:55214965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793817.1

389 aa

194

389

Serpin

PF00079 Serpin 10-386 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793817.1`	Pfam	`PF00079`	Serpin	Domain	10	386	4.7e-93	313.1	Serpin (serine protease inhibitor)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937834.1
ATATTAATATCATTGTCAATTGGAACTCTTAAATTCTTAAATCTGTTTTTTTTTACACGAGTAGCTTCACACAGTCATACTCTCTCTTCACGCACTCTCTGAAACACGCAGAGCAGCACAGTATGGACCTCCGAGAATCCATCCTCAATCAAACTGACGTTTCCGTTATGCTGGCGAAGCACGTCATCTCCGCCCACGCCAAAGACTCCAACCTCGTATTTTCTCCCTTGTCGATTCACGTCGTCTTGGGCTTGATTGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010348
ATGGACCTCCGAGAATCCATCCTCAATCAAACTGACGTTTCCGTTATGCTGGCGAAGCACGTCATCTCCGCCCACGCCAAAGACTCCAACCTCGTATTTTCTCCCTTGTCGATTCACGTCGTCTTGGGCTTGATTGCGGCCGGGTCGGACGGGCCGACCCGGCTCCAGCTCCTCAGTTTTCTCAATAGCAAGTCTACTGAGGAACTCGACTTGCTCTCCTCGCAGCTTGTGACTTTGGTGTTGGCCGACGGCAGCGCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793817.1
MDLRESILNQTDVSVMLAKHVISAHAKDSNLVFSPLSIHVVLGLIAAGSDGPTRLQLLSFLNSKSTEELDLLSSQLVTLVLADGSALGGPLLSFANGVWVDRSVSLKPAYKDILENSYRAASVQADFQNQAVEATKEVNAWADKETNGLIKEVLPSGSIDASTRLILANAVYFKGAWNEKFDASETKDHEFFLLNGSSVKAPFMTSKKKQYLRAFDGFKVLGLPYKQGEDKRKFSMYIFLPEAKDGLPALIEKAGSGSGF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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