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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003411`

染色体: Chr02 坐标: 55274907-55280014 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003411`
名称	SmilChr02G003411
描述	protein OSB1, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55274907 - 55280014 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010365`
GeneID	`131010365`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010365`
原始查询	`SmilChr02G003411`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein OSB1, mitochondrial-like
产物	protein OSB1%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT1G47720` (OSB1) Primosome PriB/single-strand DNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841183] identity=36.6; qcov=0.955; evalue=2.48e-45; confidence=medium
Rice	`Os03g0633900` - identity=33.6; qcov=0.796; evalue=1.57e-24; confidence=low
GO	GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0006264 (mitochondrial DNA replication); GO:0042645 (mitochondrial nucleoid); GO:0051096 (positive regulation of helicase activity)
KEGG	-
Pfam	PF30937 (OSB_PDF); PF30940 (OSB_SSB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010365

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057793843.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793843.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793843.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793843.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793843.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55274987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B53,B68,B71,C45,C79
`Chr2:55275027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:55275044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B53,B68,B71,C45,C79
`Chr2:55275092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C70
`Chr2:55275102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B93,C2,C82
`Chr2:55275107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793843.1

270 aa

135

270

OSB_SSB

OSB_PDF

PF30940 OSB_SSB 68-164 aa PF30937 OSB_PDF 198-247 aa

XP_057793844.1

269 aa

134

269

OSB_SSB

OSB_PDF

PF30940 OSB_SSB 68-163 aa PF30937 OSB_PDF 197-246 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793843.1`	Pfam	`PF30940`	OSB_SSB	Domain	68	164	7.8e-17	62.0	OSB SSB domain
`XP_057793843.1`	Pfam	`PF30937`	OSB_PDF	Repeat	198	247	4.9e-18	65.1	OSB PDF repeat
`XP_057793844.1`	Pfam	`PF30940`	OSB_SSB	Domain	68	163	5e-17	62.7	OSB SSB domain
`XP_057793844.1`	Pfam	`PF30937`	OSB_PDF	Repeat	197	246	4.8e-18	65.1	OSB PDF repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937860.1
CAACTGCTGATTCCCAAATTTAAAAAGCTCAACCTACAACATGAAACCAGCCGCCGAAGCCCAACTTGATGAGGACTACCCTTCTCTCTCTCCAATTGAAGAAGACACTCTTCTCTGCCCGCCTTTTCTCGTCCTCCGCCGCCCGGCCCTCCACCCACGCGCCCGAAAACTCAGACGTCGAAAGCGCCGTTTACCGGCGCGCCCTCAAGCTCCAGCGACCTACCACTGTCAGCTACCGTGATTATTTGCAGTCTGTCGGC...

XM_057937861.1
CTGCTGATTCCCAAATTTAAAAAGCTCAACCTACAACATGAAACCAGCCGCCGAAGCCCAACTTGATGAGGACTACCCTTCTCTCTCTCCAATTGAAGAAGACACTCTTCTCTGCCCGCCTTTTCTCGTCCTCCGCCGCCCGGCCCTCCACCCACGCGCCCGAAAACTCAGACGTCGAAAGCGCCGTTTACCGGCGCGCCCTCAAGCTCCAGCGACCTACCACTGTCAGCTACCGTGATTATTTGCAGTCTGTCGGCTAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010365
ATGAGGACTACCCTTCTCTCTCTCCAATTGAAGAAGACACTCTTCTCTGCCCGCCTTTTCTCGTCCTCCGCCGCCCGGCCCTCCACCCACGCGCCCGAAAACTCAGACGTCGAAAGCGCCGTTTACCGGCGCGCCCTCAAGCTCCAGCGACCTACCACTGTCAGCTACCGTGATTATTTGCAGTCTGTCGGCTACCTAGAAAACTTGCACAACTTTGTGAGCTTAATTGGTGCCATAGATTATCCTCTCAAAGCTTGCAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057793843.1
MRTTLLSLQLKKTLFSARLFSSSAARPSTHAPENSDVESAVYRRALKLQRPTTVSYRDYLQSVGYLENLHNFVSLIGAIDYPLKACSAAVGFGVYTLLRVRAPNRDLVRMLLKFRKEMAEISVQHLKAHDLVYVSGRLQSYLKLAEDGSSVRCYEVDVKEMNFVAQNVPELACQNLVKLEPKVSLEQKRRDRLHLWQVFFANPSEWWDNRNSKLKGRAPDFRHKDTGEALWIQDNDPPWVNQQLQLHDSRLSKQSYRRDK...

XP_057793844.1
MRTTLLSLQLKKTLFSARLFSSSAARPSTHAPENSDVESAVYRRALKLQRPTTVSYRDYLQSVGYLENLHNFVSLIGAIDYPLKACSAAVGFGVYTLLRVRAPNRDLVMLLKFRKEMAEISVQHLKAHDLVYVSGRLQSYLKLAEDGSSVRCYEVDVKEMNFVAQNVPELACQNLVKLEPKVSLEQKRRDRLHLWQVFFANPSEWWDNRNSKLKGRAPDFRHKDTGEALWIQDNDPPWVNQQLQLHDSRLSKQSYRRDKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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