当前解析结果
SmilChr02G003414| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003414 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003414 |
| 描述 | protein MIZU-KUSSEI 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 55337147 - 55338223 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131010394 |
|---|---|
| GeneID | 131010394 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131010394 |
| 原始查询 | SmilChr02G003414 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein MIZU-KUSSEI 1 |
| 产物 | protein MIZU-KUSSEI 1 |
| Arabidopsis | AT5G42680 (AT5G42680)MIZU-KUSSEI-like protein (Protein of unknown function, DUF617) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834277] identity=62; qcov=1.03; evalue=1.54e-95; confidence=high |
| Rice | Os09g0463600- identity=61.7; qcov=0.954; evalue=1.68e-89; confidence=high |
| GO | GO:0010274 (hydrotropism) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04759 (DUF617) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131010394 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057793875.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057793875.1 |
| 3 | Nucleolus | 核仁 | 0.20000 | XP_057793875.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057793875.1 |
| 5 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057793875.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:55337455 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr2:55337766 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C57 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057793875.1PF04759
DUF617 59-217 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057793875.1 |
Pfam | PF04759 |
DUF617 | Family | 59 | 217 | 3.7e-64 | 216.3 | Protein of unknown function, DUF617 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。