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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003418`

染色体: Chr02 坐标: 55406754-55409079 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003418`
名称	SmilChr02G003418
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55406754 - 55409079 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010396`
GeneID	`131010396`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010396`
原始查询	`SmilChr02G003418`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.5-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.5-like
Arabidopsis	`AT1G69850` (NRT1:2) nitrate transporter 1:2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843321] identity=41.8; qcov=0.971; evalue=5.58e-146; confidence=medium
Rice	`Os01g0748950` - identity=44.6; qcov=0.95; evalue=4.18e-170; confidence=medium
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010396

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057793879.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793879.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793879.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793879.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793879.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55406826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B75,B77,C40,C44
`Chr2:55406832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:55406845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:55406948`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A25
`Chr2:55406948`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A25
`Chr2:55406987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr2:55406993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C68
`Chr2:55407050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B42,B43,B65
`Chr2:55407053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:55407067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:55407089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,C64,C66
`Chr2:55407092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B44,B53,B68,B71,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793879.1

581 aa

290

581

PTR2

PF00854 PTR2 91-511 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793879.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	91	511	5.8e-86	289.6	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937896.1
TTATTACTAAGATTCCTCATATTCATTGCCTGTCACTATGACTTGTATATAAACACACAGTTGAAGAGATGCTAGAGCCTTCAACCCTCATTGGACCAAACAAGCAAGCTAAGGCATTGCATGAAAATGGGGATTCTTGGAAATGAAAACATCCAACATGGGCAGCAAGCAGGGGCCAAGGGAGGTAGAAGAGCAACCGTGTTTGTCTTTGCGATGACAACGCTGGAGACAATGGCGTTCCTTTCAAACGGAGTGAGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010396
ATGAAAATGGGGATTCTTGGAAATGAAAACATCCAACATGGGCAGCAAGCAGGGGCCAAGGGAGGTAGAAGAGCAACCGTGTTTGTCTTTGCGATGACAACGCTGGAGACAATGGCGTTCCTTTCAAACGGAGTGAGCTTAGTGACTTACTTCTACGGTTACATGAACTTCGGCTTAACCAAGTCTGCCACCACTCTTACAAACTTCATGGGGACTACCTTTCTCCTCTCTCTATTCGGAGGATTCATCTCAGACACTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793879.1
MKMGILGNENIQHGQQAGAKGGRRATVFVFAMTTLETMAFLSNGVSLVTYFYGYMNFGLTKSATTLTNFMGTTFLLSLFGGFISDTYLSRFKTCILFGCFEILGYSLLAVQAHLKQLRPLPCKDATIGCESASSNQEAILFTGLYLVALGTGGIKGALASLGADQYDERDPKEAASLSSFFNWYMFSVTFGGMFGVTFLVWISTNQGWDWSFGVCGLAVAVAILLLAMGRSLYRTNVPKGTSPLVRILQVLVVAVRNRNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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