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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003419`

染色体: Chr02 坐标: 55413708-55416396 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003419`
名称	SmilChr02G003419
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55413708 - 55416396 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010398`
GeneID	`131010398`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010398`
原始查询	`SmilChr02G003419`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.5-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 4.5-like
Arabidopsis	`AT1G27040` (AT1G27040) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839593] identity=43.4; qcov=0.937; evalue=5.28e-151; confidence=medium
Rice	`Os01g0748950` - identity=45.3; qcov=0.961; evalue=3.14e-177; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010398

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057793881.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793881.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793881.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793881.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793881.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55413959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B75
`Chr2:55414018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B36,C51,C54,C56
`Chr2:55414021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C71
`Chr2:55414023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr2:55414041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B122,B14,B26
`Chr2:55414053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,B99,D11
`Chr2:55414129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr2:55414132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr2:55414153`	`AC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A5,B59,C29,C6
`Chr2:55414192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	60	A24,A5,B102,B108,B111,B117,B118,B122,B124,B125,B132,B134,B138,B18,B19,B21,B27,B37,B41,B42,B45,B55,B65,B66,B73,B75,B78,B80,B81,B86,B89,B90,B92,C10,C12,C16,C22,C23,C24,C28,C29,C31,C35,C38,C39,C42,C63,C65,C67,C68,C7,C71,C72,C76,C86,D10,D3,D6,D8,D9
`Chr2:55414209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,B67,B95,C14
`Chr2:55414236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793881.1

588 aa

294

588

PTR2

PF00854 PTR2 91-517 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793881.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	91	517	2.2e-87	294.2	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937898.1
AATTATTACTAAGATTCCTCATATTCATTGGCTGTCACTATGTGCTCAACCCATTTCTGCCTTGTATATAAACACACACTTCAAGAGATGCTGGAGCATTCAGCCCTCATTGGAGCAAGCTAAGGCATTGCATGAAAATGGGGATTCTTGGAAATGAAAACATCCAACATAAGCAGCAAGCAGGGGCCAAGGGAGGCAGCAGAGCAACCGTGTTTGTCTTTGCGATGACAATACTGGAGACGATGGCGTTCCTTTCAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010398
ATGAAAATGGGGATTCTTGGAAATGAAAACATCCAACATAAGCAGCAAGCAGGGGCCAAGGGAGGCAGCAGAGCAACCGTGTTTGTCTTTGCGATGACAATACTGGAGACGATGGCGTTCCTTTCAAACGGAGTGAGCTTAGTGACTTACTTCTACGGTTACATGAACTTCGGCTTAACCAAGTCTGCCACCACTCTTACAAACTTCATGGGGACTGCCTTTCTCCTCTCTCTATTCGGAGGATTCATCTCAGACACATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793881.1
MKMGILGNENIQHKQQAGAKGGSRATVFVFAMTILETMAFLSNGVSLVTYFYGYMNFGLTKSATTLTNFMGTAFLLSLFGGFISDTYLSRFKTCIVFGCFEILGYSLLAVQAHLKQLRPLPCKDATIGCESASGNQEAILFTGLYLVALGTGGIKAALPSLGADQYDERDPKEAASLSSFFNWYMFSVTFGAMFGVTFLVWISTNQGWDWSFGVCGLAVAAAILFLAMGRSLYRTNVPKGTSPLVRILQVLVVAVRNRNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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