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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003420`

染色体: Chr02 坐标: 55421849-55423989 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003420`
名称	SmilChr02G003420
描述	uncharacterized SmilChr02G003420
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55421849 - 55423989 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009759`
GeneID	`131009759`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009759`
原始查询	`SmilChr02G003420`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=low
产物	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G31150` (AT1G31150) K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000] identity=31.7; qcov=0.332; evalue=6.71e-09; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009759

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793151.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793151.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793151.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793151.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793151.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55421910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr2:55421940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B19,C40
`Chr2:55422517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C55
`Chr2:55422528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B64,B97,C35,C72
`Chr2:55422549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:55422566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C80,D4
`Chr2:55422588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B86
`Chr2:55422617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C31,C64,D6
`Chr2:55422742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C50
`Chr2:55422742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr2:55422785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr2:55422787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793151.1

437 aa

218

437

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 251-428 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793151.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	251	428	2.4e-15	57.7	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937168.1
ATGAGTTCAACGGAATCAGATTACGATGGGGAAGAAGCACATAGAGGAAGTCGCCCGAGTACATCAAGGAGGAGTGAAAAATACCCGACGCCGAATCCGCCTCCGAGGCATGCTTGGTTACGTCCGTGCATGCAAGGTTATGCCGGACGAATCAATCACTACATCAAGGATAAAACACTGAAGGAAGTGGAGACCTGTCTGACGCATTACCGGCGTTTTGAACAATTTAAGATAGGTCCGTTTGGGCATTTACTTAAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009759
ATGAGTTCAACGGAATCAGATTACGATGGGGAAGAAGCACATAGAGGAAGTCGCCCGAGTACATCAAGGAGGAGTGAAAAATACCCGACGCCGAATCCGCCTCCGAGGCATGCTTGGTTACGTCCGTGCATGCAAGGTTATGCCGGACGAATCAATCACTACATCAAGGATAAAACACTGAAGGAAGTGGAGACCTGTCTGACGCATTACCGGCGTTTTGAACAATTTAAGATAGGTCCGTTTGGGCATTTACTTAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793151.1
MSSTESDYDGEEAHRGSRPSTSRRSEKYPTPNPPPRHAWLRPCMQGYAGRINHYIKDKTLKEVETCLTHYRRFEQFKIGPFGHLLKLKRQDSANAALHQLLARELYDEAFGPWEKWFHVGGHDIRFSALEYCLVTGLCFGPSPQRFDPNVDHRVGKESVWHRVFKGKKVEVKDLRKRFVSRSMGNIAEDYLKVANILVAGRSAVVRQNQQWIARGHTRLVAGVTRERTPIAFLDFYETLFREFRSLHPDEPDWDNIRDRH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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