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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003421`

染色体: Chr02 坐标: 55424065-55424964 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003421`
名称	SmilChr02G003421
描述	uncharacterized SmilChr02G003421
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55424065 - 55424964 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009760`
GeneID	`131009760`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009760`
原始查询	`SmilChr02G003421`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=28.7; qcov=0.896; evalue=2.13e-27; confidence=low
Rice	`Os08g0326300` - identity=27.8; qcov=0.819; evalue=2.24e-24; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009760

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057793152.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793152.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793152.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793152.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793152.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55424123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,B82
`Chr2:55424232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:55424244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B50,C63
`Chr2:55424256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr2:55424279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr2:55424283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C39
`Chr2:55424297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B100,B89,C39
`Chr2:55424357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B25
`Chr2:55424358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B87
`Chr2:55424358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr2:55424360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,C7,C74
`Chr2:55424378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793152.1

299 aa

150

299

Transposase_mut

MULE

PF00872 Transposase_mut 28-128 aa PF10551 MULE 29-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793152.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	28	128	1.4e-11	44.6	Transposase, Mutator family
`XP_057793152.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	29	123	1.9e-21	76.9	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937169.1
ATGAAGGACGATGGCAAGTTTCATCATATGTTTGTTGCACTTGGACAGAGCGTGGCTGCCTTTGAGAAGGGTTACTTGAGGCCGGTCATCGTCGTAGACGGGACCCATCTGAAGGGAAGGAACGGCGGCATTTTGTTCGTCGCTGTTACAAAGGATGGGAACGAAGCAATATTTCCTCTCGCAGTTGGGCTTGGTCCTATCGAGAACGACGAGTCTTGGACTTGGTTCTTCCACCGACTGCGGACTTGCTTTGGTCAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009760
ATGAAGGACGATGGCAAGTTTCATCATATGTTTGTTGCACTTGGACAGAGCGTGGCTGCCTTTGAGAAGGGTTACTTGAGGCCGGTCATCGTCGTAGACGGGACCCATCTGAAGGGAAGGAACGGCGGCATTTTGTTCGTCGCTGTTACAAAGGATGGGAACGAAGCAATATTTCCTCTCGCAGTTGGGCTTGGTCCTATCGAGAACGACGAGTCTTGGACTTGGTTCTTCCACCGACTGCGGACTTGCTTTGGTCAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793152.1
MKDDGKFHHMFVALGQSVAAFEKGYLRPVIVVDGTHLKGRNGGILFVAVTKDGNEAIFPLAVGLGPIENDESWTWFFHRLRTCFGQPDDLLIVSDQHKSIRNAVECVYPNVPHGLCYYHIQKNLAHYGQHVAAVFKAAAYSYRSDDFQRNFSALQLLKVNAHTRLDTIGVERWARSKCPVRRTSFMTSNAAETMNSRLLWARRLPVASLIETYRAIMEKWFDRRRISAASRSHELTEVVEGKLHVAVEAGRQLAVRVLPC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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