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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003429`

染色体: Chr02 坐标: 55511556-55513279 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003429`
名称	SmilChr02G003429
描述	protein JINGUBANG-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55511556 - 55513279 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010405`
GeneID	`131010405`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010405`
原始查询	`SmilChr02G003429`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein JINGUBANG-like
产物	protein JINGUBANG-like
Arabidopsis	`AT2G26490` (AT2G26490) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817190] identity=69; qcov=0.953; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0738700` (OsWD40-89) - identity=58.5; qcov=1.01; evalue=3.11e-166; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010405

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057793890.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057793890.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793890.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793890.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793890.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55511975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:55512011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C79
`Chr2:55512260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C34
`Chr2:55512350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr2:55512368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C23,C86
`Chr2:55512427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr2:55512431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C30
`Chr2:55512515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,D11
`Chr2:55512525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr2:55512528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr2:55512688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C49
`Chr2:55512815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793890.1

430 aa

215

430

WD40

PF00400 WD40 85-110 aa PF00400 WD40 190-222 aa PF00400 WD40 228-263 aa PF00400 WD40 276-311 aa PF00400 WD40 321-352 aa PF00400 WD40 361-404 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793890.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	85	110	3.4e-37	126.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057793890.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	190	222	3.4e-37	126.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057793890.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	228	263	3.4e-37	126.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057793890.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	276	311	3.4e-37	126.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057793890.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	321	352	3.4e-37	126.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057793890.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	361	404	3.4e-37	126.0	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937907.1
GACGTCCAACGTCGACCATACATATAACAACTACCAGTTTTGACAGTTTGAATCCAACTCCAAAATTGATATGGCCGTTAAAATCTCCCCGCAGTCCTAAAATGTATCTCCATCACTCTCTCTCCACCTCCAACAATCCTTCTTCTCTCCTCCTTAGCTTAGCTTGTGTCTCATTTGTCGATAATAGCAATTAATGAAGCAATGTCGTCTGCAGAGAAGAACAGCATGGCGGGCAACATGGTCCACCCGGATCCCAACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010405
ATGTCGTCTGCAGAGAAGAACAGCATGGCGGGCAACATGGTCCACCCGGATCCCAACTTGTCGTCGTCGAGCGGCGACATAGACGAGTACCGCAACAGCAGCTTCAACGGGTACGAGCCGAACCGCAATAGCGGGGAGGGGTCCCCGATGATGATGTCGCCGTGGAACCAGCCCGGCGGCGCGTGGTCGGCCCCCAGCAAGAACTCGTCTCAGCAACTGCAGAACAGCCTGATCGGCTCCCTGGTCCGCGAGGAGGGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793890.1
MSSAEKNSMAGNMVHPDPNLSSSSGDIDEYRNSSFNGYEPNRNSGEGSPMMMSPWNQPGGAWSAPSKNSSQQLQNSLIGSLVREEGHIYSLAAKDDILYTGSDSKNIRVWKSMKDFSAFKSNSGLVKAIIIADDKIFTGHQDGKIRVWKISPKNPSVYKRSGTMPTFFDIFKASIKPGNYVEVRRKRSAVWIKHADAISCLSMDKDTGFLYSASWDKTFKVWRPENSKCMESVKAHDDAVNSVVASTAAMVYTGSADGKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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